Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRAF1Q13077 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TRAF1Q13077 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRAF1Q13077 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRAF1Q13077 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TRAF1Q13077 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TRAF1Q13077 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
TRAF1Q13077 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRAF1Q13077 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRAF1Q13077 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRAF1Q13077 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRAF1Q13077 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRAF1Q13077 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRAF1Q13077 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRAF1Q13077 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRAF1Q13077 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRAF1Q13077 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRAF1Q13077 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRAF1Q13077 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRAF1Q13077 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRAF1Q13077 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRAF1Q13077 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRAF1Q13077 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRAF1Q13077 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRAF1Q13077 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRAF1Q13077 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRAF1Q13077 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRAF1Q13077 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRAF1Q13077 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRAF1Q13077 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRAF1Q13077 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRAF1Q13077 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRAF1Q13077 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAF1Q13077 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRAF1Q13077 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRAF1Q13077 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRAF1Q13077 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRAF1Q13077 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRAF1Q13077 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRAF1Q13077 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRAF1Q13077 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRAF1Q13077 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRAF1Q13077 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TRAF1Q13077 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRAF1Q13077 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRAF1Q13077 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAF1Q13077 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRAF1Q13077 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRAF1Q13077 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAF1Q13077 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRAF1Q13077 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAF1Q13077 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAF1Q13077 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAF1Q13077 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TRAF1Q13077 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRAF1Q13077 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRAF1Q13077 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRAF1Q13077 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRAF1Q13077 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRAF1Q13077 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRAF1Q13077 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAF1Q13077 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAF1Q13077 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAF1Q13077 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRAF1Q13077 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRAF1Q13077 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRAF1Q13077 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAF1Q13077 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAF1Q13077 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRAF1Q13077 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRAF1Q13077 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAF1Q13077 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRAF1Q13077 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TRAF1Q13077 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAF1Q13077 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAF1Q13077 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRAF1Q13077 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRAF1Q13077 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAF1Q13077 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAF1Q13077 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRAF1Q13077 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRAF1Q13077 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAF1Q13077 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAF1Q13077 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRAF1Q13077 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRAF1Q13077 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAF1Q13077 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRAF1Q13077 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TRAF1Q13077 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAF1Q13077 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAF1Q13077 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAF1Q13077 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAF1Q13077 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAF1Q13077 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAF1Q13077 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAF1Q13077 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAF1Q13077 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAF1Q13077 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAF1Q13077 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAF1Q13077 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
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