Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC16Q13042 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC16Q13042 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC16Q13042 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC16Q13042 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC16Q13042 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC16Q13042 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC16Q13042 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC16Q13042 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC16Q13042 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC16Q13042 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC16Q13042 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC16Q13042 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CDC16Q13042 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC16Q13042 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC16Q13042 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC16Q13042 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC16Q13042 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC16Q13042 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC16Q13042 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC16Q13042 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC16Q13042 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC16Q13042 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC16Q13042 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC16Q13042 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC16Q13042 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC16Q13042 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC16Q13042 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC16Q13042 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC16Q13042 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC16Q13042 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC16Q13042 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC16Q13042 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC16Q13042 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC16Q13042 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC16Q13042 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC16Q13042 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC16Q13042 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC16Q13042 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC16Q13042 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC16Q13042 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC16Q13042 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC16Q13042 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC16Q13042 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC16Q13042 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC16Q13042 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC16Q13042 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC16Q13042 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC16Q13042 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC16Q13042 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC16Q13042 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC16Q13042 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC16Q13042 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC16Q13042 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC16Q13042 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC16Q13042 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC16Q13042 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC16Q13042 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC16Q13042 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDC16Q13042 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC16Q13042 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC16Q13042 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC16Q13042 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC16Q13042 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC16Q13042 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC16Q13042 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC16Q13042 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC16Q13042 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC16Q13042 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC16Q13042 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC16Q13042 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC16Q13042 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC16Q13042 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC16Q13042 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC16Q13042 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC16Q13042 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC16Q13042 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC16Q13042 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDC16Q13042 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC16Q13042 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC16Q13042 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC16Q13042 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC16Q13042 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC16Q13042 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC16Q13042 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC16Q13042 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC16Q13042 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC16Q13042 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDC16Q13042 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC16Q13042 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
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