Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4Q12950 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4Q12950 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4Q12950 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4Q12950 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4Q12950 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4Q12950 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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