Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL10A1Q03692 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL10A1Q03692 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL10A1Q03692 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL10A1Q03692 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL10A1Q03692 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL10A1Q03692 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL10A1Q03692 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL10A1Q03692 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL10A1Q03692 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL10A1Q03692 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL10A1Q03692 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL10A1Q03692 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL10A1Q03692 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL10A1Q03692 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL10A1Q03692 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL10A1Q03692 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL10A1Q03692 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL10A1Q03692 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL10A1Q03692 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL10A1Q03692 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL10A1Q03692 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL10A1Q03692 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL10A1Q03692 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL10A1Q03692 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL10A1Q03692 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL10A1Q03692 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL10A1Q03692 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL10A1Q03692 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL10A1Q03692 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL10A1Q03692 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL10A1Q03692 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL10A1Q03692 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL10A1Q03692 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL10A1Q03692 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL10A1Q03692 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL10A1Q03692 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL10A1Q03692 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL10A1Q03692 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL10A1Q03692 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL10A1Q03692 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL10A1Q03692 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL10A1Q03692 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL10A1Q03692 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL10A1Q03692 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL10A1Q03692 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL10A1Q03692 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL10A1Q03692 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL10A1Q03692 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL10A1Q03692 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL10A1Q03692 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL10A1Q03692 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL10A1Q03692 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL10A1Q03692 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL10A1Q03692 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL10A1Q03692 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL10A1Q03692 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL10A1Q03692 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL10A1Q03692 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL10A1Q03692 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COL10A1Q03692 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL10A1Q03692 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL10A1Q03692 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL10A1Q03692 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL10A1Q03692 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL10A1Q03692 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL10A1Q03692 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL10A1Q03692 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL10A1Q03692 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL10A1Q03692 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL10A1Q03692 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL10A1Q03692 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL10A1Q03692 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL10A1Q03692 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL10A1Q03692 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL10A1Q03692 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL10A1Q03692 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL10A1Q03692 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL10A1Q03692 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL10A1Q03692 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL10A1Q03692 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL10A1Q03692 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL10A1Q03692 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL10A1Q03692 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL10A1Q03692 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL10A1Q03692 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL10A1Q03692 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms