Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL10A1Q03692 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL10A1Q03692 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
COL10A1Q03692 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL10A1Q03692 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL10A1Q03692 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL10A1Q03692 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL10A1Q03692 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL10A1Q03692 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL10A1Q03692 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL10A1Q03692 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL10A1Q03692 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL10A1Q03692 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL10A1Q03692 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL10A1Q03692 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL10A1Q03692 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL10A1Q03692 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL10A1Q03692 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL10A1Q03692 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL10A1Q03692 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL10A1Q03692 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL10A1Q03692 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL10A1Q03692 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL10A1Q03692 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL10A1Q03692 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL10A1Q03692 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL10A1Q03692 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL10A1Q03692 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL10A1Q03692 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL10A1Q03692 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL10A1Q03692 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL10A1Q03692 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL10A1Q03692 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL10A1Q03692 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL10A1Q03692 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL10A1Q03692 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL10A1Q03692 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL10A1Q03692 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL10A1Q03692 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL10A1Q03692 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL10A1Q03692 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL10A1Q03692 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL10A1Q03692 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL10A1Q03692 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL10A1Q03692 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL10A1Q03692 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL10A1Q03692 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL10A1Q03692 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL10A1Q03692 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL10A1Q03692 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL10A1Q03692 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL10A1Q03692 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL10A1Q03692 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL10A1Q03692 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL10A1Q03692 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL10A1Q03692 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL10A1Q03692 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL10A1Q03692 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL10A1Q03692 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL10A1Q03692 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL10A1Q03692 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL10A1Q03692 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL10A1Q03692 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL10A1Q03692 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL10A1Q03692 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL10A1Q03692 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL10A1Q03692 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL10A1Q03692 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL10A1Q03692 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL10A1Q03692 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL10A1Q03692 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL10A1Q03692 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL10A1Q03692 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL10A1Q03692 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL10A1Q03692 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL10A1Q03692 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL10A1Q03692 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL10A1Q03692 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL10A1Q03692 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL10A1Q03692 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL10A1Q03692 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL10A1Q03692 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL10A1Q03692 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL10A1Q03692 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL10A1Q03692 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL10A1Q03692 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL10A1Q03692 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL10A1Q03692 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL10A1Q03692 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL10A1Q03692 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COL10A1Q03692 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL10A1Q03692 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL10A1Q03692 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL10A1Q03692 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL10A1Q03692 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL10A1Q03692 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL10A1Q03692 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL10A1Q03692 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL10A1Q03692 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL10A1Q03692 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms