Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH3BP2P78314 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3BP2P78314 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3BP2P78314 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3BP2P78314 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH3BP2P78314 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH3BP2P78314 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3BP2P78314 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3BP2P78314 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH3BP2P78314 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3BP2P78314 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH3BP2P78314 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH3BP2P78314 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH3BP2P78314 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3BP2P78314 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3BP2P78314 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3BP2P78314 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH3BP2P78314 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH3BP2P78314 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH3BP2P78314 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH3BP2P78314 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3BP2P78314 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3BP2P78314 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH3BP2P78314 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH3BP2P78314 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH3BP2P78314 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH3BP2P78314 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2P78314 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2P78314 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3BP2P78314 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3BP2P78314 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH3BP2P78314 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH3BP2P78314 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH3BP2P78314 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH3BP2P78314 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH3BP2P78314 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SH3BP2P78314 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH3BP2P78314 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH3BP2P78314 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH3BP2P78314 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH3BP2P78314 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH3BP2P78314 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH3BP2P78314 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH3BP2P78314 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH3BP2P78314 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH3BP2P78314 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH3BP2P78314 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH3BP2P78314 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SH3BP2P78314 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH3BP2P78314 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3BP2P78314 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH3BP2P78314 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3BP2P78314 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3BP2P78314 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3BP2P78314 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3BP2P78314 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3BP2P78314 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3BP2P78314 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3BP2P78314 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3BP2P78314 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3BP2P78314 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3BP2P78314 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH3BP2P78314 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH3BP2P78314 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SH3BP2P78314 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH3BP2P78314 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH3BP2P78314 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SH3BP2P78314 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3BP2P78314 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3BP2P78314 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3BP2P78314 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3BP2P78314 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP2P78314 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP2P78314 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH3BP2P78314 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3BP2P78314 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3BP2P78314 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3BP2P78314 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3BP2P78314 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3BP2P78314 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3BP2P78314 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3BP2P78314 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3BP2P78314 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3BP2P78314 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3BP2P78314 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3BP2P78314 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3BP2P78314 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3BP2P78314 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3BP2P78314 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3BP2P78314 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3BP2P78314 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3BP2P78314 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3BP2P78314 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH3BP2P78314 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3BP2P78314 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH3BP2P78314 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3BP2P78314 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP2P78314 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP2P78314 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP2P78314 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms