Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB2AP61019 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB2AP61019 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB2AP61019 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB2AP61019 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB2AP61019 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB2AP61019 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB2AP61019 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB2AP61019 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB2AP61019 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB2AP61019 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB2AP61019 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB2AP61019 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB2AP61019 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB2AP61019 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB2AP61019 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB2AP61019 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB2AP61019 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB2AP61019 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB2AP61019 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB2AP61019 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB2AP61019 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB2AP61019 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB2AP61019 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB2AP61019 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB2AP61019 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB2AP61019 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB2AP61019 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB2AP61019 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB2AP61019 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB2AP61019 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB2AP61019 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB2AP61019 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB2AP61019 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB2AP61019 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB2AP61019 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB2AP61019 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB2AP61019 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB2AP61019 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB2AP61019 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB2AP61019 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB2AP61019 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB2AP61019 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB2AP61019 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB2AP61019 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB2AP61019 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB2AP61019 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB2AP61019 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB2AP61019 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB2AP61019 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB2AP61019 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB2AP61019 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB2AP61019 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB2AP61019 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB2AP61019 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB2AP61019 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB2AP61019 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB2AP61019 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB2AP61019 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB2AP61019 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB2AP61019 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB2AP61019 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB2AP61019 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB2AP61019 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB2AP61019 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB2AP61019 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB2AP61019 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB2AP61019 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB2AP61019 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB2AP61019 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB2AP61019 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB2AP61019 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB2AP61019 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB2AP61019 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB2AP61019 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB2AP61019 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB2AP61019 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB2AP61019 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB2AP61019 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB2AP61019 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB2AP61019 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB2AP61019 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB2AP61019 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB2AP61019 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB2AP61019 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB2AP61019 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB2AP61019 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB2AP61019 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB2AP61019 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB2AP61019 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB2AP61019 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB2AP61019 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB2AP61019 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB2AP61019 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB2AP61019 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB2AP61019 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB2AP61019 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB2AP61019 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB2AP61019 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB2AP61019 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms