Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00313P59037 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00313P59037 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00313P59037 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00313P59037 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00313P59037 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00313P59037 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00313P59037 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00313P59037 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00313P59037 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00313P59037 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00313P59037 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00313P59037 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00313P59037 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00313P59037 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00313P59037 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00313P59037 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00313P59037 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00313P59037 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00313P59037 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00313P59037 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00313P59037 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00313P59037 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00313P59037 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00313P59037 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00313P59037 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms