Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1H2P55055 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1H2P55055 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1H2P55055 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR1H2P55055 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR1H2P55055 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR1H2P55055 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1H2P55055 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1H2P55055 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR1H2P55055 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR1H2P55055 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR1H2P55055 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR1H2P55055 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR1H2P55055 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR1H2P55055 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NR1H2P55055 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR1H2P55055 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR1H2P55055 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR1H2P55055 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR1H2P55055 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR1H2P55055 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR1H2P55055 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1H2P55055 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR1H2P55055 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR1H2P55055 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NR1H2P55055 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR1H2P55055 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NR1H2P55055 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1H2P55055 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR1H2P55055 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR1H2P55055 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1H2P55055 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1H2P55055 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR1H2P55055 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1H2P55055 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1H2P55055 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H2P55055 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H2P55055 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1H2P55055 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1H2P55055 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1H2P55055 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1H2P55055 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR1H2P55055 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1H2P55055 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1H2P55055 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1H2P55055 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1H2P55055 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1H2P55055 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1H2P55055 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1H2P55055 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1H2P55055 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1H2P55055 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1H2P55055 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1H2P55055 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1H2P55055 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1H2P55055 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1H2P55055 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1H2P55055 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1H2P55055 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1H2P55055 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1H2P55055 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1H2P55055 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1H2P55055 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1H2P55055 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1H2P55055 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1H2P55055 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1H2P55055 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1H2P55055 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1H2P55055 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1H2P55055 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1H2P55055 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1H2P55055 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1H2P55055 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1H2P55055 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1H2P55055 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1H2P55055 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1H2P55055 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NR1H2P55055 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1H2P55055 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1H2P55055 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1H2P55055 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1H2P55055 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1H2P55055 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1H2P55055 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1H2P55055 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1H2P55055 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1H2P55055 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1H2P55055 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1H2P55055 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1H2P55055 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR1H2P55055 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR1H2P55055 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1H2P55055 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1H2P55055 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1H2P55055 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1H2P55055 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1H2P55055 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1H2P55055 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1H2P55055 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1H2P55055 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms