Protein–RNA interactions for Protein: P51512

MMP16, Matrix metalloproteinase-16, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP16P51512 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP16P51512 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP16P51512 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP16P51512 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP16P51512 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP16P51512 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP16P51512 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP16P51512 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP16P51512 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP16P51512 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP16P51512 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP16P51512 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP16P51512 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP16P51512 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP16P51512 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP16P51512 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP16P51512 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP16P51512 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP16P51512 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP16P51512 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP16P51512 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP16P51512 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP16P51512 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP16P51512 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP16P51512 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP16P51512 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MMP16P51512 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MMP16P51512 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP16P51512 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP16P51512 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP16P51512 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP16P51512 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP16P51512 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP16P51512 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP16P51512 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP16P51512 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP16P51512 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP16P51512 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP16P51512 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP16P51512 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP16P51512 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP16P51512 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP16P51512 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP16P51512 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP16P51512 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP16P51512 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP16P51512 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP16P51512 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP16P51512 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP16P51512 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP16P51512 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP16P51512 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP16P51512 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP16P51512 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP16P51512 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP16P51512 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP16P51512 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP16P51512 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP16P51512 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP16P51512 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP16P51512 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP16P51512 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP16P51512 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP16P51512 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP16P51512 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP16P51512 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP16P51512 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP16P51512 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP16P51512 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP16P51512 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP16P51512 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP16P51512 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP16P51512 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP16P51512 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP16P51512 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP16P51512 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP16P51512 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP16P51512 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP16P51512 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP16P51512 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP16P51512 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP16P51512 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP16P51512 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP16P51512 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP16P51512 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP16P51512 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP16P51512 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP16P51512 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP16P51512 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP16P51512 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP16P51512 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP16P51512 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP16P51512 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP16P51512 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP16P51512 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP16P51512 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP16P51512 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP16P51512 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP16P51512 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP16P51512 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms