Protein–RNA interactions for Protein: P51512

MMP16, Matrix metalloproteinase-16, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP16P51512 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP16P51512 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MMP16P51512 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP16P51512 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP16P51512 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP16P51512 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP16P51512 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP16P51512 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMP16P51512 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP16P51512 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP16P51512 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP16P51512 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP16P51512 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP16P51512 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP16P51512 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP16P51512 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP16P51512 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP16P51512 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP16P51512 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP16P51512 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP16P51512 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP16P51512 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP16P51512 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP16P51512 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MMP16P51512 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP16P51512 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP16P51512 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP16P51512 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MMP16P51512 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP16P51512 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP16P51512 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP16P51512 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MMP16P51512 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP16P51512 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP16P51512 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP16P51512 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP16P51512 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP16P51512 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP16P51512 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP16P51512 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP16P51512 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP16P51512 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP16P51512 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP16P51512 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP16P51512 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP16P51512 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP16P51512 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MMP16P51512 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MMP16P51512 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MMP16P51512 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP16P51512 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP16P51512 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP16P51512 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP16P51512 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP16P51512 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP16P51512 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP16P51512 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP16P51512 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP16P51512 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP16P51512 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP16P51512 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP16P51512 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP16P51512 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP16P51512 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP16P51512 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP16P51512 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP16P51512 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP16P51512 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP16P51512 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP16P51512 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP16P51512 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP16P51512 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP16P51512 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP16P51512 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP16P51512 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP16P51512 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP16P51512 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP16P51512 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP16P51512 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP16P51512 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP16P51512 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP16P51512 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP16P51512 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP16P51512 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP16P51512 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP16P51512 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP16P51512 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP16P51512 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP16P51512 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP16P51512 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP16P51512 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP16P51512 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP16P51512 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP16P51512 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP16P51512 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP16P51512 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP16P51512 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP16P51512 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP16P51512 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP16P51512 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms