Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSEN1P49768 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSEN1P49768 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSEN1P49768 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSEN1P49768 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSEN1P49768 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSEN1P49768 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSEN1P49768 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSEN1P49768 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSEN1P49768 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSEN1P49768 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSEN1P49768 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSEN1P49768 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PSEN1P49768 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSEN1P49768 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSEN1P49768 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSEN1P49768 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PSEN1P49768 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSEN1P49768 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PSEN1P49768 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSEN1P49768 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSEN1P49768 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSEN1P49768 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSEN1P49768 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSEN1P49768 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSEN1P49768 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSEN1P49768 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSEN1P49768 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSEN1P49768 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSEN1P49768 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSEN1P49768 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSEN1P49768 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSEN1P49768 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSEN1P49768 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSEN1P49768 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSEN1P49768 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSEN1P49768 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSEN1P49768 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PSEN1P49768 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSEN1P49768 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PSEN1P49768 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PSEN1P49768 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSEN1P49768 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSEN1P49768 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSEN1P49768 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSEN1P49768 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSEN1P49768 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSEN1P49768 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSEN1P49768 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSEN1P49768 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSEN1P49768 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSEN1P49768 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSEN1P49768 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSEN1P49768 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSEN1P49768 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSEN1P49768 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSEN1P49768 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSEN1P49768 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSEN1P49768 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSEN1P49768 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PSEN1P49768 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSEN1P49768 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSEN1P49768 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSEN1P49768 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSEN1P49768 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSEN1P49768 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSEN1P49768 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSEN1P49768 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSEN1P49768 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSEN1P49768 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSEN1P49768 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSEN1P49768 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSEN1P49768 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSEN1P49768 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSEN1P49768 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSEN1P49768 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSEN1P49768 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PSEN1P49768 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSEN1P49768 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSEN1P49768 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSEN1P49768 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PSEN1P49768 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSEN1P49768 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSEN1P49768 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSEN1P49768 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSEN1P49768 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSEN1P49768 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSEN1P49768 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PSEN1P49768 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSEN1P49768 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PSEN1P49768 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSEN1P49768 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSEN1P49768 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSEN1P49768 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSEN1P49768 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSEN1P49768 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSEN1P49768 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSEN1P49768 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSEN1P49768 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSEN1P49768 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms