Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PSEN1P49768 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PSEN1P49768 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PSEN1P49768 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PSEN1P49768 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PSEN1P49768 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PSEN1P49768 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PSEN1P49768 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PSEN1P49768 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSEN1P49768 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PSEN1P49768 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PSEN1P49768 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PSEN1P49768 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PSEN1P49768 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PSEN1P49768 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PSEN1P49768 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PSEN1P49768 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PSEN1P49768 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSEN1P49768 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PSEN1P49768 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PSEN1P49768 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PSEN1P49768 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSEN1P49768 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PSEN1P49768 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PSEN1P49768 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSEN1P49768 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PSEN1P49768 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSEN1P49768 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSEN1P49768 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PSEN1P49768 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PSEN1P49768 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSEN1P49768 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSEN1P49768 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PSEN1P49768 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSEN1P49768 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSEN1P49768 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PSEN1P49768 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PSEN1P49768 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PSEN1P49768 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSEN1P49768 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PSEN1P49768 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSEN1P49768 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSEN1P49768 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSEN1P49768 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PSEN1P49768 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PSEN1P49768 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PSEN1P49768 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PSEN1P49768 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PSEN1P49768 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PSEN1P49768 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PSEN1P49768 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSEN1P49768 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PSEN1P49768 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSEN1P49768 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSEN1P49768 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PSEN1P49768 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSEN1P49768 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSEN1P49768 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PSEN1P49768 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSEN1P49768 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PSEN1P49768 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSEN1P49768 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSEN1P49768 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSEN1P49768 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSEN1P49768 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSEN1P49768 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSEN1P49768 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSEN1P49768 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSEN1P49768 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PSEN1P49768 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSEN1P49768 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSEN1P49768 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PSEN1P49768 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PSEN1P49768 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PSEN1P49768 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PSEN1P49768 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PSEN1P49768 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PSEN1P49768 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSEN1P49768 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PSEN1P49768 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PSEN1P49768 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSEN1P49768 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSEN1P49768 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSEN1P49768 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSEN1P49768 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSEN1P49768 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSEN1P49768 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSEN1P49768 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSEN1P49768 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSEN1P49768 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
PSEN1P49768 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSEN1P49768 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSEN1P49768 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSEN1P49768 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PSEN1P49768 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSEN1P49768 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSEN1P49768 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSEN1P49768 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSEN1P49768 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSEN1P49768 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms