Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRP9P49458 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP9P49458 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP9P49458 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP9P49458 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP9P49458 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP9P49458 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP9P49458 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP9P49458 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP9P49458 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP9P49458 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP9P49458 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP9P49458 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP9P49458 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP9P49458 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP9P49458 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP9P49458 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP9P49458 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP9P49458 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP9P49458 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRP9P49458 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRP9P49458 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP9P49458 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP9P49458 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRP9P49458 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRP9P49458 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP9P49458 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRP9P49458 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRP9P49458 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRP9P49458 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRP9P49458 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP9P49458 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP9P49458 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP9P49458 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRP9P49458 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRP9P49458 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRP9P49458 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP9P49458 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP9P49458 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP9P49458 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP9P49458 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP9P49458 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP9P49458 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP9P49458 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP9P49458 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRP9P49458 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP9P49458 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP9P49458 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP9P49458 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRP9P49458 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRP9P49458 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRP9P49458 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRP9P49458 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP9P49458 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP9P49458 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP9P49458 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP9P49458 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP9P49458 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP9P49458 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP9P49458 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP9P49458 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP9P49458 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP9P49458 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP9P49458 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP9P49458 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP9P49458 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP9P49458 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP9P49458 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP9P49458 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRP9P49458 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRP9P49458 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRP9P49458 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRP9P49458 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP9P49458 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP9P49458 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP9P49458 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP9P49458 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP9P49458 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP9P49458 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP9P49458 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP9P49458 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP9P49458 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP9P49458 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP9P49458 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP9P49458 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP9P49458 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP9P49458 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP9P49458 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP9P49458 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP9P49458 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP9P49458 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP9P49458 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP9P49458 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP9P49458 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP9P49458 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP9P49458 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRP9P49458 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP9P49458 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP9P49458 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP9P49458 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 893.6 ms