Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMAN1P49257 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMAN1P49257 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMAN1P49257 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMAN1P49257 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMAN1P49257 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMAN1P49257 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMAN1P49257 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMAN1P49257 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMAN1P49257 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMAN1P49257 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMAN1P49257 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMAN1P49257 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMAN1P49257 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMAN1P49257 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMAN1P49257 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMAN1P49257 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMAN1P49257 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMAN1P49257 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMAN1P49257 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMAN1P49257 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LMAN1P49257 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMAN1P49257 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMAN1P49257 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMAN1P49257 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMAN1P49257 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMAN1P49257 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMAN1P49257 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMAN1P49257 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMAN1P49257 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMAN1P49257 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMAN1P49257 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMAN1P49257 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMAN1P49257 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMAN1P49257 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMAN1P49257 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMAN1P49257 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMAN1P49257 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMAN1P49257 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMAN1P49257 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMAN1P49257 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMAN1P49257 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMAN1P49257 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMAN1P49257 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMAN1P49257 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LMAN1P49257 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMAN1P49257 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMAN1P49257 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMAN1P49257 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMAN1P49257 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMAN1P49257 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LMAN1P49257 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMAN1P49257 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMAN1P49257 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMAN1P49257 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMAN1P49257 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMAN1P49257 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMAN1P49257 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMAN1P49257 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMAN1P49257 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMAN1P49257 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMAN1P49257 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LMAN1P49257 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMAN1P49257 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMAN1P49257 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMAN1P49257 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMAN1P49257 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMAN1P49257 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMAN1P49257 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMAN1P49257 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMAN1P49257 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LMAN1P49257 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMAN1P49257 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMAN1P49257 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMAN1P49257 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMAN1P49257 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMAN1P49257 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMAN1P49257 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMAN1P49257 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMAN1P49257 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMAN1P49257 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMAN1P49257 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMAN1P49257 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMAN1P49257 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMAN1P49257 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMAN1P49257 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMAN1P49257 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMAN1P49257 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMAN1P49257 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMAN1P49257 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMAN1P49257 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMAN1P49257 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMAN1P49257 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMAN1P49257 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMAN1P49257 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMAN1P49257 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMAN1P49257 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMAN1P49257 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMAN1P49257 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMAN1P49257 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms