Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TDO2P48775 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TDO2P48775 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TDO2P48775 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TDO2P48775 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TDO2P48775 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
TDO2P48775 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TDO2P48775 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TDO2P48775 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TDO2P48775 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TDO2P48775 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TDO2P48775 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TDO2P48775 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TDO2P48775 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TDO2P48775 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TDO2P48775 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TDO2P48775 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TDO2P48775 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TDO2P48775 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TDO2P48775 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TDO2P48775 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TDO2P48775 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TDO2P48775 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TDO2P48775 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TDO2P48775 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TDO2P48775 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TDO2P48775 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TDO2P48775 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TDO2P48775 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TDO2P48775 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TDO2P48775 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TDO2P48775 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TDO2P48775 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TDO2P48775 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TDO2P48775 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TDO2P48775 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TDO2P48775 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TDO2P48775 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TDO2P48775 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TDO2P48775 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TDO2P48775 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
TDO2P48775 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TDO2P48775 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TDO2P48775 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TDO2P48775 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TDO2P48775 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TDO2P48775 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TDO2P48775 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TDO2P48775 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TDO2P48775 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDO2P48775 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDO2P48775 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDO2P48775 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TDO2P48775 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TDO2P48775 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TDO2P48775 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
TDO2P48775 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TDO2P48775 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TDO2P48775 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TDO2P48775 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TDO2P48775 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TDO2P48775 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TDO2P48775 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TDO2P48775 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TDO2P48775 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TDO2P48775 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TDO2P48775 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TDO2P48775 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TDO2P48775 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TDO2P48775 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
TDO2P48775 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TDO2P48775 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TDO2P48775 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TDO2P48775 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TDO2P48775 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TDO2P48775 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TDO2P48775 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TDO2P48775 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TDO2P48775 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TDO2P48775 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TDO2P48775 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TDO2P48775 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TDO2P48775 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TDO2P48775 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TDO2P48775 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TDO2P48775 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TDO2P48775 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TDO2P48775 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TDO2P48775 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TDO2P48775 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TDO2P48775 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TDO2P48775 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TDO2P48775 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TDO2P48775 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TDO2P48775 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TDO2P48775 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TDO2P48775 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TDO2P48775 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TDO2P48775 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TDO2P48775 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms