Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TDO2P48775 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
TDO2P48775 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TDO2P48775 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
TDO2P48775 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TDO2P48775 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
TDO2P48775 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TDO2P48775 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TDO2P48775 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TDO2P48775 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TDO2P48775 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TDO2P48775 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TDO2P48775 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TDO2P48775 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
TDO2P48775 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TDO2P48775 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TDO2P48775 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TDO2P48775 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TDO2P48775 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TDO2P48775 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TDO2P48775 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TDO2P48775 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TDO2P48775 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TDO2P48775 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TDO2P48775 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TDO2P48775 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TDO2P48775 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TDO2P48775 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TDO2P48775 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TDO2P48775 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TDO2P48775 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TDO2P48775 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TDO2P48775 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TDO2P48775 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TDO2P48775 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TDO2P48775 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TDO2P48775 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TDO2P48775 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TDO2P48775 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TDO2P48775 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TDO2P48775 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TDO2P48775 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TDO2P48775 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TDO2P48775 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TDO2P48775 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TDO2P48775 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TDO2P48775 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TDO2P48775 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TDO2P48775 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TDO2P48775 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TDO2P48775 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TDO2P48775 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TDO2P48775 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TDO2P48775 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TDO2P48775 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TDO2P48775 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TDO2P48775 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TDO2P48775 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TDO2P48775 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
TDO2P48775 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TDO2P48775 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TDO2P48775 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TDO2P48775 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TDO2P48775 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TDO2P48775 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TDO2P48775 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TDO2P48775 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TDO2P48775 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TDO2P48775 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TDO2P48775 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TDO2P48775 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TDO2P48775 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TDO2P48775 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TDO2P48775 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TDO2P48775 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TDO2P48775 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TDO2P48775 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TDO2P48775 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TDO2P48775 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TDO2P48775 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TDO2P48775 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TDO2P48775 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TDO2P48775 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TDO2P48775 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TDO2P48775 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TDO2P48775 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TDO2P48775 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TDO2P48775 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TDO2P48775 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TDO2P48775 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TDO2P48775 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
TDO2P48775 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TDO2P48775 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TDO2P48775 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
TDO2P48775 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TDO2P48775 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TDO2P48775 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TDO2P48775 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TDO2P48775 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TDO2P48775 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms