Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCG1P45844 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCG1P45844 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCG1P45844 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCG1P45844 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCG1P45844 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCG1P45844 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCG1P45844 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCG1P45844 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCG1P45844 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCG1P45844 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCG1P45844 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCG1P45844 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCG1P45844 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCG1P45844 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCG1P45844 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCG1P45844 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCG1P45844 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCG1P45844 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCG1P45844 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCG1P45844 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCG1P45844 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCG1P45844 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCG1P45844 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCG1P45844 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCG1P45844 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCG1P45844 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCG1P45844 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCG1P45844 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCG1P45844 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCG1P45844 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCG1P45844 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCG1P45844 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCG1P45844 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCG1P45844 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCG1P45844 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCG1P45844 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCG1P45844 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCG1P45844 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCG1P45844 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCG1P45844 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCG1P45844 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCG1P45844 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCG1P45844 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCG1P45844 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCG1P45844 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCG1P45844 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCG1P45844 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCG1P45844 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCG1P45844 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCG1P45844 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCG1P45844 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCG1P45844 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCG1P45844 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCG1P45844 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCG1P45844 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCG1P45844 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCG1P45844 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCG1P45844 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCG1P45844 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCG1P45844 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCG1P45844 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCG1P45844 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCG1P45844 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCG1P45844 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCG1P45844 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCG1P45844 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCG1P45844 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCG1P45844 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCG1P45844 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCG1P45844 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCG1P45844 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ABCG1P45844 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCG1P45844 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCG1P45844 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms