Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNNT3P45378 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNNT3P45378 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNNT3P45378 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNNT3P45378 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNNT3P45378 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TNNT3P45378 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNNT3P45378 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNNT3P45378 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TNNT3P45378 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNNT3P45378 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNNT3P45378 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNNT3P45378 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNNT3P45378 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNNT3P45378 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNT3P45378 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNT3P45378 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNT3P45378 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNT3P45378 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNT3P45378 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNT3P45378 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNNT3P45378 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNNT3P45378 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNT3P45378 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNT3P45378 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNNT3P45378 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNNT3P45378 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNNT3P45378 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNNT3P45378 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNNT3P45378 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNT3P45378 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNNT3P45378 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNT3P45378 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNT3P45378 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNT3P45378 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNNT3P45378 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNNT3P45378 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNNT3P45378 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNT3P45378 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNT3P45378 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNNT3P45378 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNNT3P45378 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TNNT3P45378 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNNT3P45378 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNNT3P45378 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNT3P45378 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNNT3P45378 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNNT3P45378 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNNT3P45378 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNT3P45378 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNNT3P45378 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNNT3P45378 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNNT3P45378 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNNT3P45378 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNT3P45378 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TNNT3P45378 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TNNT3P45378 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNNT3P45378 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNT3P45378 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNT3P45378 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNNT3P45378 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNNT3P45378 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNNT3P45378 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNNT3P45378 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNNT3P45378 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNNT3P45378 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNNT3P45378 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNT3P45378 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TNNT3P45378 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNT3P45378 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNT3P45378 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNT3P45378 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNNT3P45378 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNNT3P45378 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNNT3P45378 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNNT3P45378 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNNT3P45378 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNNT3P45378 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNT3P45378 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNNT3P45378 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNNT3P45378 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNNT3P45378 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNNT3P45378 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNNT3P45378 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNNT3P45378 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNT3P45378 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNNT3P45378 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNNT3P45378 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNNT3P45378 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNT3P45378 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNNT3P45378 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNT3P45378 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TNNT3P45378 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNNT3P45378 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNNT3P45378 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNNT3P45378 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNNT3P45378 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNNT3P45378 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNNT3P45378 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNNT3P45378 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms