Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NDUFS1P28331 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NDUFS1P28331 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NDUFS1P28331 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NDUFS1P28331 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NDUFS1P28331 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NDUFS1P28331 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NDUFS1P28331 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NDUFS1P28331 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NDUFS1P28331 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NDUFS1P28331 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NDUFS1P28331 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NDUFS1P28331 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NDUFS1P28331 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NDUFS1P28331 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NDUFS1P28331 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NDUFS1P28331 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NDUFS1P28331 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NDUFS1P28331 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NDUFS1P28331 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NDUFS1P28331 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NDUFS1P28331 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NDUFS1P28331 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NDUFS1P28331 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NDUFS1P28331 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NDUFS1P28331 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NDUFS1P28331 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NDUFS1P28331 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NDUFS1P28331 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NDUFS1P28331 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NDUFS1P28331 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NDUFS1P28331 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NDUFS1P28331 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NDUFS1P28331 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NDUFS1P28331 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NDUFS1P28331 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NDUFS1P28331 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDUFS1P28331 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NDUFS1P28331 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDUFS1P28331 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDUFS1P28331 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDUFS1P28331 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NDUFS1P28331 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDUFS1P28331 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NDUFS1P28331 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NDUFS1P28331 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NDUFS1P28331 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NDUFS1P28331 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NDUFS1P28331 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NDUFS1P28331 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NDUFS1P28331 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDUFS1P28331 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NDUFS1P28331 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NDUFS1P28331 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NDUFS1P28331 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NDUFS1P28331 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NDUFS1P28331 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NDUFS1P28331 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDUFS1P28331 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDUFS1P28331 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDUFS1P28331 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDUFS1P28331 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDUFS1P28331 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NDUFS1P28331 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFS1P28331 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFS1P28331 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFS1P28331 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDUFS1P28331 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDUFS1P28331 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDUFS1P28331 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDUFS1P28331 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDUFS1P28331 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDUFS1P28331 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NDUFS1P28331 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDUFS1P28331 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDUFS1P28331 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDUFS1P28331 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDUFS1P28331 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDUFS1P28331 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NDUFS1P28331 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NDUFS1P28331 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDUFS1P28331 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDUFS1P28331 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NDUFS1P28331 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDUFS1P28331 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDUFS1P28331 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDUFS1P28331 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDUFS1P28331 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDUFS1P28331 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NDUFS1P28331 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDUFS1P28331 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDUFS1P28331 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NDUFS1P28331 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NDUFS1P28331 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NDUFS1P28331 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDUFS1P28331 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NDUFS1P28331 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NDUFS1P28331 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDUFS1P28331 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NDUFS1P28331 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms