Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
P0DMU3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
P0DMU3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
P0DMU3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
P0DMU3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
P0DMU3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P0DMU3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
P0DMU3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P0DMU3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
P0DMU3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P0DMU3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P0DMU3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P0DMU3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P0DMU3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
P0DMU3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P0DMU3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P0DMU3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P0DMU3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P0DMU3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
P0DMU3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P0DMU3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P0DMU3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P0DMU3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P0DMU3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P0DMU3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P0DMU3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P0DMU3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P0DMU3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P0DMU3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P0DMU3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P0DMU3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P0DMU3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P0DMU3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P0DMU3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P0DMU3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P0DMU3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P0DMU3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P0DMU3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P0DMU3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P0DMU3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P0DMU3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P0DMU3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P0DMU3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P0DMU3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P0DMU3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P0DMU3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P0DMU3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P0DMU3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P0DMU3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P0DMU3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P0DMU3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P0DMU3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P0DMU3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P0DMU3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P0DMU3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P0DMU3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P0DMU3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P0DMU3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P0DMU3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P0DMU3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P0DMU3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P0DMU3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P0DMU3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P0DMU3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P0DMU3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P0DMU3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P0DMU3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P0DMU3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P0DMU3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P0DMU3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
P0DMU3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P0DMU3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P0DMU3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P0DMU3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P0DMU3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P0DMU3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P0DMU3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P0DMU3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P0DMU3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P0DMU3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P0DMU3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P0DMU3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P0DMU3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P0DMU3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P0DMU3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P0DMU3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P0DMU3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P0DMU3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P0DMU3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P0DMU3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P0DMU3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P0DMU3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P0DMU3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P0DMU3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P0DMU3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P0DMU3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P0DMU3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P0DMU3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P0DMU3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P0DMU3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms