Protein–RNA interactions for Protein: P0CG32

ZCCHC18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC18P0CG32 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZCCHC18P0CG32 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZCCHC18P0CG32 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZCCHC18P0CG32 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZCCHC18P0CG32 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZCCHC18P0CG32 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZCCHC18P0CG32 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZCCHC18P0CG32 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZCCHC18P0CG32 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZCCHC18P0CG32 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZCCHC18P0CG32 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZCCHC18P0CG32 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZCCHC18P0CG32 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC18P0CG32 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZCCHC18P0CG32 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZCCHC18P0CG32 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZCCHC18P0CG32 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZCCHC18P0CG32 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZCCHC18P0CG32 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZCCHC18P0CG32 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZCCHC18P0CG32 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZCCHC18P0CG32 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZCCHC18P0CG32 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZCCHC18P0CG32 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZCCHC18P0CG32 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZCCHC18P0CG32 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC18P0CG32 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZCCHC18P0CG32 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZCCHC18P0CG32 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZCCHC18P0CG32 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZCCHC18P0CG32 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZCCHC18P0CG32 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC18P0CG32 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZCCHC18P0CG32 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZCCHC18P0CG32 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC18P0CG32 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC18P0CG32 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC18P0CG32 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC18P0CG32 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZCCHC18P0CG32 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZCCHC18P0CG32 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZCCHC18P0CG32 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZCCHC18P0CG32 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZCCHC18P0CG32 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZCCHC18P0CG32 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC18P0CG32 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZCCHC18P0CG32 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC18P0CG32 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC18P0CG32 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC18P0CG32 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZCCHC18P0CG32 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZCCHC18P0CG32 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZCCHC18P0CG32 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZCCHC18P0CG32 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC18P0CG32 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC18P0CG32 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZCCHC18P0CG32 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZCCHC18P0CG32 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZCCHC18P0CG32 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZCCHC18P0CG32 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC18P0CG32 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC18P0CG32 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC18P0CG32 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC18P0CG32 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZCCHC18P0CG32 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC18P0CG32 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZCCHC18P0CG32 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC18P0CG32 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC18P0CG32 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC18P0CG32 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZCCHC18P0CG32 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC18P0CG32 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC18P0CG32 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZCCHC18P0CG32 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC18P0CG32 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZCCHC18P0CG32 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC18P0CG32 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZCCHC18P0CG32 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC18P0CG32 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC18P0CG32 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZCCHC18P0CG32 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZCCHC18P0CG32 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZCCHC18P0CG32 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZCCHC18P0CG32 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZCCHC18P0CG32 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZCCHC18P0CG32 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZCCHC18P0CG32 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC18P0CG32 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZCCHC18P0CG32 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZCCHC18P0CG32 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZCCHC18P0CG32 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZCCHC18P0CG32 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC18P0CG32 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZCCHC18P0CG32 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC18P0CG32 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC18P0CG32 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC18P0CG32 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZCCHC18P0CG32 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC18P0CG32 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZCCHC18P0CG32 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms