Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKCGP05129 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKCGP05129 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKCGP05129 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKCGP05129 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKCGP05129 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKCGP05129 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKCGP05129 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKCGP05129 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKCGP05129 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKCGP05129 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKCGP05129 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKCGP05129 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKCGP05129 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKCGP05129 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKCGP05129 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKCGP05129 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKCGP05129 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKCGP05129 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKCGP05129 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKCGP05129 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKCGP05129 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKCGP05129 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKCGP05129 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRKCGP05129 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKCGP05129 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKCGP05129 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKCGP05129 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCGP05129 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCGP05129 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCGP05129 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCGP05129 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKCGP05129 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKCGP05129 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKCGP05129 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKCGP05129 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRKCGP05129 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCGP05129 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCGP05129 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCGP05129 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCGP05129 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKCGP05129 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCGP05129 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCGP05129 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKCGP05129 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCGP05129 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCGP05129 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCGP05129 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCGP05129 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCGP05129 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCGP05129 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKCGP05129 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKCGP05129 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCGP05129 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCGP05129 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCGP05129 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCGP05129 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCGP05129 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCGP05129 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKCGP05129 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCGP05129 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCGP05129 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCGP05129 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCGP05129 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRKCGP05129 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCGP05129 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCGP05129 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCGP05129 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCGP05129 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKCGP05129 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKCGP05129 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKCGP05129 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCGP05129 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCGP05129 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKCGP05129 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCGP05129 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCGP05129 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKCGP05129 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKCGP05129 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCGP05129 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCGP05129 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCGP05129 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKCGP05129 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCGP05129 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRKCGP05129 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCGP05129 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCGP05129 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCGP05129 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCGP05129 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCGP05129 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCGP05129 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCGP05129 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCGP05129 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKCGP05129 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKCGP05129 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCGP05129 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCGP05129 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCGP05129 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCGP05129 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCGP05129 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms