Protein–RNA interactions for Protein: P04430

IGKV1-16, Immunoglobulin kappa variable 1-16, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-16P04430 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV1-16P04430 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV1-16P04430 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV1-16P04430 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGKV1-16P04430 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV1-16P04430 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV1-16P04430 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV1-16P04430 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGKV1-16P04430 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGKV1-16P04430 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGKV1-16P04430 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGKV1-16P04430 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGKV1-16P04430 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV1-16P04430 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGKV1-16P04430 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGKV1-16P04430 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGKV1-16P04430 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV1-16P04430 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV1-16P04430 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV1-16P04430 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV1-16P04430 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGKV1-16P04430 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGKV1-16P04430 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGKV1-16P04430 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV1-16P04430 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGKV1-16P04430 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV1-16P04430 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV1-16P04430 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGKV1-16P04430 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV1-16P04430 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGKV1-16P04430 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGKV1-16P04430 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1-16P04430 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1-16P04430 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV1-16P04430 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV1-16P04430 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1-16P04430 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1-16P04430 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1-16P04430 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV1-16P04430 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV1-16P04430 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV1-16P04430 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV1-16P04430 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV1-16P04430 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV1-16P04430 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGKV1-16P04430 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1-16P04430 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1-16P04430 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1-16P04430 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1-16P04430 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1-16P04430 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1-16P04430 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV1-16P04430 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1-16P04430 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1-16P04430 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1-16P04430 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1-16P04430 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1-16P04430 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1-16P04430 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1-16P04430 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1-16P04430 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1-16P04430 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1-16P04430 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1-16P04430 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1-16P04430 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-16P04430 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-16P04430 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-16P04430 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV1-16P04430 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV1-16P04430 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1-16P04430 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV1-16P04430 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV1-16P04430 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1-16P04430 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1-16P04430 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV1-16P04430 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1-16P04430 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1-16P04430 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1-16P04430 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1-16P04430 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1-16P04430 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV1-16P04430 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms