Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDN9O95484 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDN9O95484 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDN9O95484 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDN9O95484 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDN9O95484 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDN9O95484 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN9O95484 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN9O95484 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLDN9O95484 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN9O95484 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDN9O95484 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN9O95484 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN9O95484 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLDN9O95484 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLDN9O95484 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN9O95484 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLDN9O95484 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLDN9O95484 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLDN9O95484 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLDN9O95484 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLDN9O95484 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLDN9O95484 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN9O95484 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN9O95484 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN9O95484 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN9O95484 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN9O95484 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN9O95484 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN9O95484 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN9O95484 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN9O95484 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN9O95484 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN9O95484 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLDN9O95484 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CLDN9O95484 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLDN9O95484 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLDN9O95484 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN9O95484 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN9O95484 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLDN9O95484 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLDN9O95484 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN9O95484 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN9O95484 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLDN9O95484 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN9O95484 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN9O95484 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN9O95484 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN9O95484 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN9O95484 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN9O95484 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN9O95484 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN9O95484 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN9O95484 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN9O95484 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN9O95484 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN9O95484 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN9O95484 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN9O95484 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLDN9O95484 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLDN9O95484 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN9O95484 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN9O95484 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN9O95484 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN9O95484 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN9O95484 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN9O95484 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN9O95484 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN9O95484 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLDN9O95484 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN9O95484 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN9O95484 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN9O95484 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN9O95484 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN9O95484 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN9O95484 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLDN9O95484 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN9O95484 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN9O95484 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN9O95484 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN9O95484 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN9O95484 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN9O95484 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN9O95484 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN9O95484 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN9O95484 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN9O95484 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN9O95484 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN9O95484 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN9O95484 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN9O95484 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN9O95484 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN9O95484 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN9O95484 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN9O95484 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN9O95484 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN9O95484 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN9O95484 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN9O95484 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN9O95484 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.4 ms