Protein–RNA interactions for Protein: O75891

ALDH1L1, Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1L1O75891 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
ALDH1L1O75891 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ALDH1L1O75891 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ALDH1L1O75891 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ALDH1L1O75891 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ALDH1L1O75891 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
ALDH1L1O75891 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ALDH1L1O75891 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ALDH1L1O75891 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ALDH1L1O75891 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ALDH1L1O75891 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ALDH1L1O75891 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ALDH1L1O75891 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ALDH1L1O75891 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ALDH1L1O75891 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ALDH1L1O75891 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ALDH1L1O75891 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ALDH1L1O75891 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ALDH1L1O75891 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ALDH1L1O75891 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ALDH1L1O75891 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ALDH1L1O75891 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ALDH1L1O75891 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ALDH1L1O75891 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ALDH1L1O75891 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ALDH1L1O75891 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ALDH1L1O75891 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
ALDH1L1O75891 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ALDH1L1O75891 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ALDH1L1O75891 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ALDH1L1O75891 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ALDH1L1O75891 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ALDH1L1O75891 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ALDH1L1O75891 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ALDH1L1O75891 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ALDH1L1O75891 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ALDH1L1O75891 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ALDH1L1O75891 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ALDH1L1O75891 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ALDH1L1O75891 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
ALDH1L1O75891 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ALDH1L1O75891 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ALDH1L1O75891 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ALDH1L1O75891 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ALDH1L1O75891 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ALDH1L1O75891 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ALDH1L1O75891 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ALDH1L1O75891 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ALDH1L1O75891 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ALDH1L1O75891 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ALDH1L1O75891 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ALDH1L1O75891 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ALDH1L1O75891 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ALDH1L1O75891 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ALDH1L1O75891 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ALDH1L1O75891 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ALDH1L1O75891 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ALDH1L1O75891 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ALDH1L1O75891 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ALDH1L1O75891 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ALDH1L1O75891 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ALDH1L1O75891 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ALDH1L1O75891 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ALDH1L1O75891 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ALDH1L1O75891 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ALDH1L1O75891 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ALDH1L1O75891 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ALDH1L1O75891 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
ALDH1L1O75891 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ALDH1L1O75891 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ALDH1L1O75891 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ALDH1L1O75891 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ALDH1L1O75891 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ALDH1L1O75891 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ALDH1L1O75891 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ALDH1L1O75891 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ALDH1L1O75891 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ALDH1L1O75891 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ALDH1L1O75891 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ALDH1L1O75891 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ALDH1L1O75891 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ALDH1L1O75891 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ALDH1L1O75891 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ALDH1L1O75891 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ALDH1L1O75891 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ALDH1L1O75891 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ALDH1L1O75891 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ALDH1L1O75891 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ALDH1L1O75891 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ALDH1L1O75891 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ALDH1L1O75891 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ALDH1L1O75891 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ALDH1L1O75891 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ALDH1L1O75891 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ALDH1L1O75891 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ALDH1L1O75891 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ALDH1L1O75891 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ALDH1L1O75891 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ALDH1L1O75891 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ALDH1L1O75891 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms