Protein–RNA interactions for Protein: O14617

AP3D1, AP-3 complex subunit delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3D1O14617 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3D1O14617 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3D1O14617 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3D1O14617 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3D1O14617 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3D1O14617 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3D1O14617 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3D1O14617 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
AP3D1O14617 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3D1O14617 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3D1O14617 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3D1O14617 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3D1O14617 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3D1O14617 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3D1O14617 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3D1O14617 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3D1O14617 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3D1O14617 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP3D1O14617 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3D1O14617 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3D1O14617 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3D1O14617 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3D1O14617 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3D1O14617 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3D1O14617 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3D1O14617 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3D1O14617 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3D1O14617 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3D1O14617 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3D1O14617 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3D1O14617 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3D1O14617 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3D1O14617 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3D1O14617 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3D1O14617 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3D1O14617 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3D1O14617 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3D1O14617 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3D1O14617 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3D1O14617 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3D1O14617 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3D1O14617 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3D1O14617 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3D1O14617 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3D1O14617 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3D1O14617 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP3D1O14617 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3D1O14617 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3D1O14617 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3D1O14617 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3D1O14617 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3D1O14617 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3D1O14617 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3D1O14617 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP3D1O14617 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP3D1O14617 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP3D1O14617 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP3D1O14617 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3D1O14617 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3D1O14617 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3D1O14617 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3D1O14617 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3D1O14617 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3D1O14617 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3D1O14617 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3D1O14617 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3D1O14617 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3D1O14617 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3D1O14617 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3D1O14617 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3D1O14617 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3D1O14617 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP3D1O14617 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP3D1O14617 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms