Protein–RNA interactions for Protein: O00526

UPK2, Uroplakin-2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK2O00526 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UPK2O00526 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK2O00526 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UPK2O00526 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK2O00526 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UPK2O00526 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UPK2O00526 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UPK2O00526 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UPK2O00526 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPK2O00526 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPK2O00526 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPK2O00526 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPK2O00526 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK2O00526 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPK2O00526 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK2O00526 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK2O00526 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK2O00526 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK2O00526 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK2O00526 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK2O00526 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK2O00526 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK2O00526 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK2O00526 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK2O00526 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK2O00526 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK2O00526 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK2O00526 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK2O00526 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK2O00526 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK2O00526 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK2O00526 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK2O00526 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK2O00526 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK2O00526 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK2O00526 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK2O00526 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK2O00526 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK2O00526 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK2O00526 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK2O00526 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK2O00526 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK2O00526 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK2O00526 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK2O00526 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK2O00526 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK2O00526 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK2O00526 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK2O00526 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK2O00526 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UPK2O00526 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK2O00526 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK2O00526 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPK2O00526 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPK2O00526 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK2O00526 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK2O00526 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK2O00526 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK2O00526 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPK2O00526 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK2O00526 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPK2O00526 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UPK2O00526 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK2O00526 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK2O00526 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPK2O00526 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK2O00526 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK2O00526 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPK2O00526 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK2O00526 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK2O00526 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK2O00526 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK2O00526 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK2O00526 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK2O00526 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK2O00526 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK2O00526 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK2O00526 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK2O00526 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK2O00526 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK2O00526 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK2O00526 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK2O00526 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK2O00526 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK2O00526 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK2O00526 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK2O00526 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK2O00526 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK2O00526 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK2O00526 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK2O00526 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK2O00526 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK2O00526 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK2O00526 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK2O00526 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK2O00526 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK2O00526 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK2O00526 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK2O00526 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK2O00526 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms