Protein–RNA interactions for Protein: O00189

AP4M1, AP-4 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4M1O00189 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4M1O00189 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4M1O00189 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4M1O00189 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP4M1O00189 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4M1O00189 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4M1O00189 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4M1O00189 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4M1O00189 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4M1O00189 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4M1O00189 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4M1O00189 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4M1O00189 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4M1O00189 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4M1O00189 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4M1O00189 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4M1O00189 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4M1O00189 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4M1O00189 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4M1O00189 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4M1O00189 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4M1O00189 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4M1O00189 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4M1O00189 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4M1O00189 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4M1O00189 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4M1O00189 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4M1O00189 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP4M1O00189 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP4M1O00189 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP4M1O00189 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP4M1O00189 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4M1O00189 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP4M1O00189 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4M1O00189 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4M1O00189 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4M1O00189 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP4M1O00189 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4M1O00189 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4M1O00189 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4M1O00189 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4M1O00189 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4M1O00189 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4M1O00189 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4M1O00189 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4M1O00189 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4M1O00189 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4M1O00189 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4M1O00189 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4M1O00189 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4M1O00189 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4M1O00189 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4M1O00189 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4M1O00189 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4M1O00189 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4M1O00189 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4M1O00189 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4M1O00189 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4M1O00189 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4M1O00189 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4M1O00189 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP4M1O00189 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP4M1O00189 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4M1O00189 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4M1O00189 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP4M1O00189 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4M1O00189 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4M1O00189 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4M1O00189 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4M1O00189 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP4M1O00189 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4M1O00189 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4M1O00189 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4M1O00189 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4M1O00189 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4M1O00189 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 490.1 ms