Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TK2O00142 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TK2O00142 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TK2O00142 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TK2O00142 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TK2O00142 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TK2O00142 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TK2O00142 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TK2O00142 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TK2O00142 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TK2O00142 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TK2O00142 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TK2O00142 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TK2O00142 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TK2O00142 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TK2O00142 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TK2O00142 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TK2O00142 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TK2O00142 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TK2O00142 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TK2O00142 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TK2O00142 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TK2O00142 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TK2O00142 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TK2O00142 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TK2O00142 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TK2O00142 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TK2O00142 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TK2O00142 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TK2O00142 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TK2O00142 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TK2O00142 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TK2O00142 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TK2O00142 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TK2O00142 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TK2O00142 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TK2O00142 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TK2O00142 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TK2O00142 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TK2O00142 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TK2O00142 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TK2O00142 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TK2O00142 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TK2O00142 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TK2O00142 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TK2O00142 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TK2O00142 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TK2O00142 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TK2O00142 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TK2O00142 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TK2O00142 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TK2O00142 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TK2O00142 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TK2O00142 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TK2O00142 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TK2O00142 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TK2O00142 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TK2O00142 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TK2O00142 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TK2O00142 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TK2O00142 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TK2O00142 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TK2O00142 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TK2O00142 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TK2O00142 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TK2O00142 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TK2O00142 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TK2O00142 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TK2O00142 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TK2O00142 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TK2O00142 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TK2O00142 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TK2O00142 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TK2O00142 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TK2O00142 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TK2O00142 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TK2O00142 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TK2O00142 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TK2O00142 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TK2O00142 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TK2O00142 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TK2O00142 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TK2O00142 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TK2O00142 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TK2O00142 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TK2O00142 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TK2O00142 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TK2O00142 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TK2O00142 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TK2O00142 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TK2O00142 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TK2O00142 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TK2O00142 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TK2O00142 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TK2O00142 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TK2O00142 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TK2O00142 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TK2O00142 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TK2O00142 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TK2O00142 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms