Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU0

RFPL4A, Ret finger protein-like 4A, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4AA6NLU0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL4AA6NLU0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFPL4AA6NLU0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL4AA6NLU0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFPL4AA6NLU0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL4AA6NLU0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL4AA6NLU0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL4AA6NLU0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4AA6NLU0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4AA6NLU0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL4AA6NLU0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL4AA6NLU0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL4AA6NLU0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL4AA6NLU0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL4AA6NLU0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL4AA6NLU0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL4AA6NLU0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL4AA6NLU0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL4AA6NLU0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFPL4AA6NLU0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL4AA6NLU0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL4AA6NLU0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL4AA6NLU0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL4AA6NLU0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL4AA6NLU0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL4AA6NLU0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL4AA6NLU0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL4AA6NLU0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL4AA6NLU0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL4AA6NLU0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL4AA6NLU0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFPL4AA6NLU0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFPL4AA6NLU0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFPL4AA6NLU0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFPL4AA6NLU0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFPL4AA6NLU0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFPL4AA6NLU0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFPL4AA6NLU0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFPL4AA6NLU0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFPL4AA6NLU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFPL4AA6NLU0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFPL4AA6NLU0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFPL4AA6NLU0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFPL4AA6NLU0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFPL4AA6NLU0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFPL4AA6NLU0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFPL4AA6NLU0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFPL4AA6NLU0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFPL4AA6NLU0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFPL4AA6NLU0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL4AA6NLU0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFPL4AA6NLU0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFPL4AA6NLU0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFPL4AA6NLU0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFPL4AA6NLU0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFPL4AA6NLU0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFPL4AA6NLU0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL4AA6NLU0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL4AA6NLU0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL4AA6NLU0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL4AA6NLU0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL4AA6NLU0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL4AA6NLU0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL4AA6NLU0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL4AA6NLU0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL4AA6NLU0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL4AA6NLU0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL4AA6NLU0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFPL4AA6NLU0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFPL4AA6NLU0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFPL4AA6NLU0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFPL4AA6NLU0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL4AA6NLU0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFPL4AA6NLU0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL4AA6NLU0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFPL4AA6NLU0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL4AA6NLU0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL4AA6NLU0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFPL4AA6NLU0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL4AA6NLU0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL4AA6NLU0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL4AA6NLU0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFPL4AA6NLU0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL4AA6NLU0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL4AA6NLU0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFPL4AA6NLU0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFPL4AA6NLU0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFPL4AA6NLU0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFPL4AA6NLU0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFPL4AA6NLU0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFPL4AA6NLU0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFPL4AA6NLU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFPL4AA6NLU0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL4AA6NLU0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL4AA6NLU0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL4AA6NLU0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFPL4AA6NLU0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFPL4AA6NLU0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFPL4AA6NLU0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFPL4AA6NLU0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms