Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
VWA3AA6NCI4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
VWA3AA6NCI4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
VWA3AA6NCI4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
VWA3AA6NCI4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
VWA3AA6NCI4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
VWA3AA6NCI4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
VWA3AA6NCI4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VWA3AA6NCI4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
VWA3AA6NCI4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
VWA3AA6NCI4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VWA3AA6NCI4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
VWA3AA6NCI4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
VWA3AA6NCI4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
VWA3AA6NCI4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
VWA3AA6NCI4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
VWA3AA6NCI4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
VWA3AA6NCI4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
VWA3AA6NCI4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
VWA3AA6NCI4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
VWA3AA6NCI4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
VWA3AA6NCI4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
VWA3AA6NCI4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
VWA3AA6NCI4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
VWA3AA6NCI4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
VWA3AA6NCI4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
VWA3AA6NCI4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
VWA3AA6NCI4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
VWA3AA6NCI4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
VWA3AA6NCI4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
VWA3AA6NCI4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
VWA3AA6NCI4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
VWA3AA6NCI4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
VWA3AA6NCI4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
VWA3AA6NCI4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VWA3AA6NCI4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
VWA3AA6NCI4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
VWA3AA6NCI4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
VWA3AA6NCI4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
VWA3AA6NCI4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
VWA3AA6NCI4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
VWA3AA6NCI4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
VWA3AA6NCI4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VWA3AA6NCI4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VWA3AA6NCI4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VWA3AA6NCI4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
VWA3AA6NCI4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VWA3AA6NCI4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VWA3AA6NCI4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
VWA3AA6NCI4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
VWA3AA6NCI4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
VWA3AA6NCI4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
VWA3AA6NCI4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
VWA3AA6NCI4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
VWA3AA6NCI4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
VWA3AA6NCI4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
VWA3AA6NCI4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
VWA3AA6NCI4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
VWA3AA6NCI4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
VWA3AA6NCI4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
VWA3AA6NCI4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
VWA3AA6NCI4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
VWA3AA6NCI4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
VWA3AA6NCI4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
VWA3AA6NCI4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VWA3AA6NCI4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
VWA3AA6NCI4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
VWA3AA6NCI4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
VWA3AA6NCI4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
VWA3AA6NCI4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
VWA3AA6NCI4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
VWA3AA6NCI4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
VWA3AA6NCI4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
VWA3AA6NCI4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
VWA3AA6NCI4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
VWA3AA6NCI4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
VWA3AA6NCI4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
VWA3AA6NCI4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
VWA3AA6NCI4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
VWA3AA6NCI4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
VWA3AA6NCI4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
VWA3AA6NCI4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
VWA3AA6NCI4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
VWA3AA6NCI4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
VWA3AA6NCI4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
VWA3AA6NCI4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
VWA3AA6NCI4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
VWA3AA6NCI4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
VWA3AA6NCI4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
VWA3AA6NCI4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
VWA3AA6NCI4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
VWA3AA6NCI4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
VWA3AA6NCI4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
VWA3AA6NCI4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
VWA3AA6NCI4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
VWA3AA6NCI4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
VWA3AA6NCI4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
VWA3AA6NCI4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
VWA3AA6NCI4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
VWA3AA6NCI4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms