Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J273

TRAV34, T-cell receptor alpha variable 34 (Fragment), humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV34A0A0B4J273 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV34A0A0B4J273 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV34A0A0B4J273 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV34A0A0B4J273 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV34A0A0B4J273 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV34A0A0B4J273 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV34A0A0B4J273 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV34A0A0B4J273 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV34A0A0B4J273 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV34A0A0B4J273 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV34A0A0B4J273 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV34A0A0B4J273 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV34A0A0B4J273 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV34A0A0B4J273 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV34A0A0B4J273 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV34A0A0B4J273 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV34A0A0B4J273 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV34A0A0B4J273 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV34A0A0B4J273 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV34A0A0B4J273 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV34A0A0B4J273 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV34A0A0B4J273 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV34A0A0B4J273 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV34A0A0B4J273 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV34A0A0B4J273 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV34A0A0B4J273 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV34A0A0B4J273 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV34A0A0B4J273 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV34A0A0B4J273 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV34A0A0B4J273 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAV34A0A0B4J273 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV34A0A0B4J273 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAV34A0A0B4J273 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV34A0A0B4J273 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV34A0A0B4J273 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAV34A0A0B4J273 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAV34A0A0B4J273 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAV34A0A0B4J273 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAV34A0A0B4J273 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV34A0A0B4J273 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAV34A0A0B4J273 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAV34A0A0B4J273 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAV34A0A0B4J273 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAV34A0A0B4J273 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAV34A0A0B4J273 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAV34A0A0B4J273 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAV34A0A0B4J273 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAV34A0A0B4J273 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAV34A0A0B4J273 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAV34A0A0B4J273 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV34A0A0B4J273 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV34A0A0B4J273 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV34A0A0B4J273 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV34A0A0B4J273 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV34A0A0B4J273 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAV34A0A0B4J273 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAV34A0A0B4J273 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAV34A0A0B4J273 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAV34A0A0B4J273 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAV34A0A0B4J273 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAV34A0A0B4J273 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV34A0A0B4J273 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV34A0A0B4J273 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV34A0A0B4J273 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV34A0A0B4J273 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV34A0A0B4J273 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV34A0A0B4J273 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV34A0A0B4J273 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV34A0A0B4J273 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV34A0A0B4J273 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV34A0A0B4J273 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAV34A0A0B4J273 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV34A0A0B4J273 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV34A0A0B4J273 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV34A0A0B4J273 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAV34A0A0B4J273 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAV34A0A0B4J273 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAV34A0A0B4J273 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV34A0A0B4J273 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV34A0A0B4J273 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV34A0A0B4J273 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV34A0A0B4J273 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV34A0A0B4J273 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAV34A0A0B4J273 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAV34A0A0B4J273 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV34A0A0B4J273 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV34A0A0B4J273 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV34A0A0B4J273 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV34A0A0B4J273 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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