Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LPE2

SAA2-SAA4, SAA2-SAA4 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2-SAA4A0A096LPE2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAA2-SAA4A0A096LPE2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAA2-SAA4A0A096LPE2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAA2-SAA4A0A096LPE2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAA2-SAA4A0A096LPE2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAA2-SAA4A0A096LPE2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAA2-SAA4A0A096LPE2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAA2-SAA4A0A096LPE2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAA2-SAA4A0A096LPE2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAA2-SAA4A0A096LPE2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAA2-SAA4A0A096LPE2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAA2-SAA4A0A096LPE2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAA2-SAA4A0A096LPE2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAA2-SAA4A0A096LPE2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAA2-SAA4A0A096LPE2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAA2-SAA4A0A096LPE2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAA2-SAA4A0A096LPE2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAA2-SAA4A0A096LPE2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAA2-SAA4A0A096LPE2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAA2-SAA4A0A096LPE2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAA2-SAA4A0A096LPE2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAA2-SAA4A0A096LPE2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAA2-SAA4A0A096LPE2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAA2-SAA4A0A096LPE2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAA2-SAA4A0A096LPE2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAA2-SAA4A0A096LPE2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAA2-SAA4A0A096LPE2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAA2-SAA4A0A096LPE2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAA2-SAA4A0A096LPE2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAA2-SAA4A0A096LPE2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAA2-SAA4A0A096LPE2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAA2-SAA4A0A096LPE2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAA2-SAA4A0A096LPE2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAA2-SAA4A0A096LPE2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAA2-SAA4A0A096LPE2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAA2-SAA4A0A096LPE2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAA2-SAA4A0A096LPE2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAA2-SAA4A0A096LPE2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAA2-SAA4A0A096LPE2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAA2-SAA4A0A096LPE2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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