Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.498e-8■■■■■ 39.2
RBM22Q9NW64 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.128e-8■■■■■ 39.2
RBM22Q9NW64 UBR3-204ENST00000430321 5411 ntTSL 56.03□□□□□ -1.448e-8■■■■■ 39.2
RBM22Q9NW64 UBR3-202ENST00000392632 5129 ntTSL 54.08□□□□□ -1.768e-8■■■■■ 39.2
RBM22Q9NW64 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 RBM39-212ENST00000429968 2149 ntTSL 214.17□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 RBM39-216ENST00000444878 2124 ntTSL 213.94□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 RBM39-245ENST00000639702 5914 ntTSL 512.56□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 RBM39-223ENST00000463004 4580 ntTSL 512.11□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 RBM39-206ENST00000403542 2883 ntTSL 212.09□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 39
RBM22Q9NW64 RBM39-202ENST00000338163 2792 ntTSL 211.74□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 39
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RBM22Q9NW64 VARS2-205ENST00000469358 3429 ntTSL 512.16□□□□□ -0.467e-8■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.224e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 TPCN1-203ENST00000428632 2296 ntTSL 216.2■□□□□ 0.184e-9■■■■■ 38.9
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RBM22Q9NW64 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 TPCN1-218ENST00000551127 2975 ntTSL 213.3□□□□□ -0.284e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 RNF24-202ENST00000358395 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.424e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 TPCN1-204ENST00000541517 5173 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.454e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 TPCN1-202ENST00000392569 2558 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.644e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 TPCN1-206ENST00000546781 610 ntTSL 310.82□□□□□ -0.684e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.134e-9■■■■■ 38.9
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RBM22Q9NW64 FRYL-211ENST00000507873 7031 ntTSL 1 (best)5.23□□□□□ -1.574e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 TPCN1-205ENST00000546503 389 ntTSL 35.17□□□□□ -1.584e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 FRYL-220ENST00000641795 5566 nt4.27□□□□□ -1.734e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.744e-9■■■■■ 38.9
RBM22Q9NW64 RBM39-204ENST00000374038 1026 ntTSL 515.9■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 38.8
RBM22Q9NW64 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 38.8
RBM22Q9NW64 GMCL1-202ENST00000468386 808 ntTSL 524.79■■□□□ 1.568e-10■■■■■ 38.7
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RBM22Q9NW64 ING5-212ENST00000493578 1136 ntTSL 316.24■□□□□ 0.192e-10■■■■■ 38.7
RBM22Q9NW64 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 38.7
RBM22Q9NW64 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.223e-21■■■■■ 38.7
RBM22Q9NW64 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.486e-20■■■■■ 38.7
RBM22Q9NW64 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.416e-20■■■■■ 38.7
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RBM22Q9NW64 ATG16L2-208ENST00000537143 519 ntTSL 222.76■■□□□ 1.236e-20■■■■■ 38.7
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RBM22Q9NW64 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNRPA1-202ENST00000394082 556 ntTSL 1 (best)17.35■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 38.6
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RBM22Q9NW64 SNRPA1-210ENST00000560383 565 ntTSL 415.24■□□□□ 0.033e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNRPA1-207ENST00000559309 924 ntTSL 515.03■□□□□ -03e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 PRPF8-216ENST00000577001 3274 ntTSL 515.02□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNX14-204ENST00000369635 2578 ntTSL 514.92□□□□□ -0.023e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 38.6
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RBM22Q9NW64 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNRPA1-204ENST00000558020 466 ntTSL 313.57□□□□□ -0.243e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.333e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.473e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 CNOT1-210ENST00000567133 553 ntTSL 511.04□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 IL6ST-206ENST00000381298 9057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.713e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.733e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 ARPC3-201ENST00000228825 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNRPA1-212ENST00000560496 824 ntTSL 510.08□□□□□ -0.83e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 KIF15-204ENST00000438321 4795 ntTSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.933e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNRPA1-214ENST00000560987 478 ntTSL 29.13□□□□□ -0.953e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.983e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNRPA1-206ENST00000558059 678 ntTSL 28.81□□□□□ -13e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 ARPC3-205ENST00000475777 837 ntTSL 28.14□□□□□ -1.113e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 SNX14-219ENST00000515216 3288 ntTSL 57.86□□□□□ -1.153e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.153e-9■■■■■ 38.6
RBM22Q9NW64 PPP6R3-210ENST00000526307 4134 ntTSL 27.78□□□□□ -1.163e-9■■■■■ 38.6
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