RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577611.1

YES1-202, Transcript of YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase, humanhuman

TSL 4

Gene YES1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YES1-202ENST00000577611 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.61■■■■■ 5.53
YES1-202ENST00000577611 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.55■■■■■ 4.72
YES1-202ENST00000577611 ABCC9O60706 1549 aa44.37■■■■■ 4.69
YES1-202ENST00000577611 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.34■■■■■ 4.37
YES1-202ENST00000577611 NACADO15069 1562 aa42.05■■■■■ 4.32
YES1-202ENST00000577611 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.83■■■■■ 4.29
YES1-202ENST00000577611 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.48■■■■■ 4.23
YES1-202ENST00000577611 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.37■■■■■ 4.21
YES1-202ENST00000577611 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.37■■■■■ 4.21
YES1-202ENST00000577611 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.28■■■■■ 4.2
YES1-202ENST00000577611 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
YES1-202ENST00000577611 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.01■■■■■ 4.16
YES1-202ENST00000577611 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41■■■■■ 4.15
YES1-202ENST00000577611 SCRIBQ14160 1630 aa40.6■■■■■ 4.09
YES1-202ENST00000577611 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.56■■■■■ 4.08
YES1-202ENST00000577611 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.1■■■■■ 4.01
YES1-202ENST00000577611 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
YES1-202ENST00000577611 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.97■■■■□ 3.99
YES1-202ENST00000577611 NCAPD3P42695 1498 aa38.76■■■■□ 3.8
YES1-202ENST00000577611 SMARCA4P51532 1647 aa38.72■■■■□ 3.79
YES1-202ENST00000577611 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.68■■■■□ 3.78
YES1-202ENST00000577611 SMARCA2P51531 1590 aa38.64■■■■□ 3.78
YES1-202ENST00000577611 HMGXB3Q12766 1538 aa38.55■■■■□ 3.76
YES1-202ENST00000577611 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
YES1-202ENST00000577611 ERCC6Q03468 1493 aa38.37■■■■□ 3.73
YES1-202ENST00000577611 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
YES1-202ENST00000577611 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.31■■■■□ 3.72
YES1-202ENST00000577611 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.22■■■■□ 3.71
YES1-202ENST00000577611 CUX2O14529 1486 aa38.22■■■■□ 3.71
YES1-202ENST00000577611 NESP48681 1621 aa38.12■■■■□ 3.69
YES1-202ENST00000577611 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.95■■■■□ 3.67
YES1-202ENST00000577611 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.93■■■■□ 3.66
YES1-202ENST00000577611 WIZO95785 1651 aa37.81■■■■□ 3.64
YES1-202ENST00000577611 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
YES1-202ENST00000577611 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.71■■■■□ 3.63
YES1-202ENST00000577611 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.7■■■■□ 3.63
YES1-202ENST00000577611 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.6■■■■□ 3.61
YES1-202ENST00000577611 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
YES1-202ENST00000577611 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.38■■■■□ 3.57
YES1-202ENST00000577611 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
YES1-202ENST00000577611 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.27■■■■□ 3.56
YES1-202ENST00000577611 WDR62O43379 1518 aa37.27■■■■□ 3.56
YES1-202ENST00000577611 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.21■■■■□ 3.55
YES1-202ENST00000577611 CFTRP13569 1480 aa37.2■■■■□ 3.54
YES1-202ENST00000577611 PRDM2Q13029 1718 aa36.96■■■■□ 3.51
YES1-202ENST00000577611 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
YES1-202ENST00000577611 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.88■■■■□ 3.49
YES1-202ENST00000577611 TOPBP1Q92547 1522 aa36.52■■■■□ 3.44
YES1-202ENST00000577611 IFT140Q96RY7 1462 aa36.5■■■■□ 3.43
YES1-202ENST00000577611 ABCC8Q09428 1581 aa36.46■■■■□ 3.43
YES1-202ENST00000577611 OSCARQ8IYS5 282 aa36.43■■■■□ 3.42
YES1-202ENST00000577611 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.43■■■■□ 3.42
YES1-202ENST00000577611 TRIM41Q8WV44 630 aa36.42■■■■□ 3.42
YES1-202ENST00000577611 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
YES1-202ENST00000577611 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
YES1-202ENST00000577611 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
YES1-202ENST00000577611 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
YES1-202ENST00000577611 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.07■■■■□ 3.374e-8■■■■■ 32.6
YES1-202ENST00000577611 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.01■■■■□ 3.35
YES1-202ENST00000577611 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.01■■■■□ 3.35
YES1-202ENST00000577611 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.01■■■■□ 3.35
YES1-202ENST00000577611 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.99■■■■□ 3.35
YES1-202ENST00000577611 CHD1O14646 1710 aa35.99■■■■□ 3.35
YES1-202ENST00000577611 SOGA1O94964 1423 aa35.97■■■■□ 3.35
YES1-202ENST00000577611 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.95■■■■□ 3.35
YES1-202ENST00000577611 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
YES1-202ENST00000577611 CUX1P39880 1505 aa35.93■■■■□ 3.34
YES1-202ENST00000577611 ARHGEF11O15085 1522 aa35.9■■■■□ 3.34
YES1-202ENST00000577611 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
YES1-202ENST00000577611 WDR97A6NE52 1622 aa35.87■■■■□ 3.33
YES1-202ENST00000577611 FBLN2P98095 1184 aa35.86■■■■□ 3.33
YES1-202ENST00000577611 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.77■■■■□ 3.32
YES1-202ENST00000577611 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
YES1-202ENST00000577611 GRIN2BQ13224 1484 aa35.67■■■■□ 3.3
YES1-202ENST00000577611 PBRM1Q86U86 1689 aa35.61■■■■□ 3.29
YES1-202ENST00000577611 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
YES1-202ENST00000577611 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.58■■■■□ 3.29
YES1-202ENST00000577611 SYNJ1O43426 1573 aa35.58■■■■□ 3.29
YES1-202ENST00000577611 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.56■■■■□ 3.28
YES1-202ENST00000577611 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.55■■■■□ 3.28
YES1-202ENST00000577611 SYNJ2O15056 1496 aa35.54■■■■□ 3.28
YES1-202ENST00000577611 ARAP1Q96P48 1450 aa35.54■■■■□ 3.28
YES1-202ENST00000577611 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.52■■■■□ 3.28
YES1-202ENST00000577611 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.5■■■■□ 3.27
YES1-202ENST00000577611 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.43■■■■□ 3.26
YES1-202ENST00000577611 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.42■■■■□ 3.26
YES1-202ENST00000577611 TOP2BQ02880 1626 aa35.41■■■■□ 3.26
YES1-202ENST00000577611 ADAMTS12P58397 1594 aa35.25■■■■□ 3.23
YES1-202ENST00000577611 GRIN2AQ12879 1464 aa35.22■■■■□ 3.23
YES1-202ENST00000577611 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
YES1-202ENST00000577611 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.12■■■■□ 3.21
YES1-202ENST00000577611 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.12■■■■□ 3.21
YES1-202ENST00000577611 CEP170Q5SW79 1584 aa35.08■■■■□ 3.21
YES1-202ENST00000577611 NUP160Q12769 1436 aa35.06■■■■□ 3.2
YES1-202ENST00000577611 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.96■■■■□ 3.19
YES1-202ENST00000577611 SHROOM2Q13796 1616 aa34.92■■■■□ 3.18
YES1-202ENST00000577611 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.75■■■■□ 3.15
YES1-202ENST00000577611 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
YES1-202ENST00000577611 KIF27Q86VH2 1401 aa34.72■■■■□ 3.15
YES1-202ENST00000577611 CUL7Q14999 1698 aa34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms