Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SSR2-216ENST00000531790 476 ntTSL 57.81□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KPNA1-208ENST00000485027 1843 ntTSL 27.24□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KPNA1-207ENST00000482287 727 ntTSL 36.58□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KPNA1-205ENST00000470904 3060 ntTSL 26.19□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 KPNA1-204ENST00000466923 3316 ntTSL 25.34□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.05□□□□□ -2.242e-6■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SEZ6L2-204ENST00000537485 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 SEZ6L2-209ENST00000617533 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.721e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.391e-8■■■■■ 36.4
PCBP1Q15365 EIF4G1-233ENST00000475721 1271 ntTSL 222.17■■□□□ 1.141e-18■■■■■ 36.3
PCBP1Q15365 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 221.48■■□□□ 1.031e-18■■■■■ 36.3
PCBP1Q15365 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.953e-6■■■■■ 36.3
PCBP1Q15365 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.673e-6■■■■■ 36.3
PCBP1Q15365 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.63e-6■■■■■ 36.3
PCBP1Q15365 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 36.3
PCBP1Q15365 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 13e-6■■■■■ 36.3
PCBP1Q15365 MATK-205ENST00000587180 741 ntTSL 520.72■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 36.3
PCBP1Q15365 MATK-208ENST00000590493 801 ntTSL 315.6■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 36.3
PCBP1Q15365 MATK-206ENST00000588983 711 ntTSL 315.19■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 36.3
PCBP1Q15365 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.184e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RFXANK-204ENST00000421262 856 ntTSL 527.59■■■□□ 2.014e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APOE-202ENST00000425718 923 ntTSL 1 (best)26.66■■□□□ 1.861e-14■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.812e-8■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.692e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 SH2B1-209ENST00000563674 719 ntTSL 325.55■■□□□ 1.682e-8■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MCRIP1-209ENST00000575090 752 ntTSL 325.1■■□□□ 1.612e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 SH2B1-208ENST00000563591 588 ntTSL 225.09■■□□□ 1.612e-8■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 SH2B1-212ENST00000567536 484 ntTSL 324.97■■□□□ 1.592e-8■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 224.4■■□□□ 1.51e-14■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.294e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RFXANK-214ENST00000545522 888 ntTSL 222.72■■□□□ 1.234e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 222.53■■□□□ 1.21e-14■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.146e-10■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.112e-8■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RFXANK-210ENST00000541873 1002 ntTSL 221.91■■□□□ 1.14e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 GARS-203ENST00000454308 814 ntTSL 521.9■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RFXANK-215ENST00000593273 865 ntTSL 321.51■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.993e-11■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.984e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-217ENST00000520254 579 ntTSL 421.14■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RPS6KB2-209ENST00000528964 1806 ntTSL 520.95■□□□□ 0.944e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-221ENST00000522361 367 ntTSL 420.84■□□□□ 0.934e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-208ENST00000518344 554 ntTSL 320.67■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-219ENST00000521223 587 ntTSL 420.66■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-209ENST00000518879 820 ntTSL 520.58■□□□□ 0.894e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-219ENST00000511896 2032 ntTSL 220.43■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 GARS-206ENST00000478124 1877 ntTSL 520.31■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RFXANK-209ENST00000540981 832 ntTSL 520.18■□□□□ 0.824e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-218ENST00000511463 636 ntTSL 320.09■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.84e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-205ENST00000518167 421 ntTSL 519.93■□□□□ 0.784e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.744e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RFXANK-212ENST00000543157 919 ntTSL 219.6■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-212ENST00000506289 943 ntTSL 519.55■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RPS6KB2-207ENST00000525996 957 ntTSL 519.4■□□□□ 0.74e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-216ENST00000520204 699 ntTSL 518.28■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-210ENST00000519020 573 ntTSL 517.9■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 HUWE1-201ENST00000218328 5488 ntTSL 517.84■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-211ENST00000519070 561 ntTSL 317.83■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 EXOC3-202ENST00000503889 5365 ntTSL 517.44■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-214ENST00000509914 2020 ntTSL 1 (best)17.24■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-206ENST00000467078 1920 ntTSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 EXOC3-210ENST00000515601 5748 ntTSL 516.29■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-215ENST00000510241 2801 ntTSL 215.44■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-221ENST00000515056 2064 ntTSL 215.41■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FBXO42-202ENST00000444116 945 ntTSL 514.6□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 36.2
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 612.8 ms