RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575061.2

MCRIP1-208, Transcript of MAPK regulated corepressor interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MCRIP1, Length 618 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1-208ENST00000575061 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.72■■■■■ 5.71
MCRIP1-208ENST00000575061 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.88■■■■■ 4.78
MCRIP1-208ENST00000575061 ABCC9O60706 1549 aa42.96■■■■■ 4.47
MCRIP1-208ENST00000575061 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
MCRIP1-208ENST00000575061 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.17■■■■■ 4.34
MCRIP1-208ENST00000575061 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.13■■■■■ 4.33
MCRIP1-208ENST00000575061 NACADO15069 1562 aa42.03■■■■■ 4.32
MCRIP1-208ENST00000575061 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.87■■■■■ 4.29
MCRIP1-208ENST00000575061 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.86■■■■■ 4.29
MCRIP1-208ENST00000575061 SCRIBQ14160 1630 aa40.78■■■■■ 4.12
MCRIP1-208ENST00000575061 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.76■■■■■ 4.12
MCRIP1-208ENST00000575061 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.43■■■■■ 4.06
MCRIP1-208ENST00000575061 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.39■■■■■ 4.06
MCRIP1-208ENST00000575061 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.035e-6■■■■□ 22.2
MCRIP1-208ENST00000575061 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
MCRIP1-208ENST00000575061 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
MCRIP1-208ENST00000575061 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.29■■■■□ 3.88
MCRIP1-208ENST00000575061 SMARCA4P51532 1647 aa39.18■■■■□ 3.86
MCRIP1-208ENST00000575061 MROH2BQ7Z745 1585 aa39■■■■□ 3.83
MCRIP1-208ENST00000575061 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.97■■■■□ 3.83
MCRIP1-208ENST00000575061 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.91■■■■□ 3.82
MCRIP1-208ENST00000575061 SMARCA2P51531 1590 aa38.88■■■■□ 3.81
MCRIP1-208ENST00000575061 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
MCRIP1-208ENST00000575061 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.79■■■■□ 3.8
MCRIP1-208ENST00000575061 NCAPD3P42695 1498 aa38.74■■■■□ 3.79
MCRIP1-208ENST00000575061 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.67■■■■□ 3.78
MCRIP1-208ENST00000575061 HMGXB3Q12766 1538 aa38.63■■■■□ 3.78
MCRIP1-208ENST00000575061 WIZO95785 1651 aa38.6■■■■□ 3.77
MCRIP1-208ENST00000575061 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
MCRIP1-208ENST00000575061 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
MCRIP1-208ENST00000575061 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
MCRIP1-208ENST00000575061 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.84■■■■□ 3.65
MCRIP1-208ENST00000575061 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.62■■■■□ 3.61
MCRIP1-208ENST00000575061 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.62■■■■□ 3.61
MCRIP1-208ENST00000575061 CFTRP13569 1480 aa37.55■■■■□ 3.6
MCRIP1-208ENST00000575061 PRDM2Q13029 1718 aa37.36■■■■□ 3.57
MCRIP1-208ENST00000575061 NESP48681 1621 aa37.35■■■■□ 3.57
MCRIP1-208ENST00000575061 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.35■■■■□ 3.57
MCRIP1-208ENST00000575061 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.13■■■■□ 3.54
MCRIP1-208ENST00000575061 ERCC6Q03468 1493 aa37.07■■■■□ 3.53
MCRIP1-208ENST00000575061 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.06■■■■□ 3.52
MCRIP1-208ENST00000575061 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.99■■■■□ 3.51
MCRIP1-208ENST00000575061 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.85■■■■□ 3.49
MCRIP1-208ENST00000575061 ABCC8Q09428 1581 aa36.85■■■■□ 3.49
MCRIP1-208ENST00000575061 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
MCRIP1-208ENST00000575061 WDR62O43379 1518 aa36.71■■■■□ 3.47
MCRIP1-208ENST00000575061 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.69■■■■□ 3.46
MCRIP1-208ENST00000575061 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.68■■■■□ 3.46
MCRIP1-208ENST00000575061 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
MCRIP1-208ENST00000575061 TOPBP1Q92547 1522 aa36.62■■■■□ 3.45
MCRIP1-208ENST00000575061 CUX1P39880 1505 aa36.57■■■■□ 3.44
MCRIP1-208ENST00000575061 TOP2BQ02880 1626 aa36.54■■■■□ 3.44
MCRIP1-208ENST00000575061 CUX2O14529 1486 aa36.54■■■■□ 3.44
MCRIP1-208ENST00000575061 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.52■■■■□ 3.44
MCRIP1-208ENST00000575061 SYNJ1O43426 1573 aa36.44■■■■□ 3.42
MCRIP1-208ENST00000575061 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
MCRIP1-208ENST00000575061 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.35■■■■□ 3.41
MCRIP1-208ENST00000575061 IFT140Q96RY7 1462 aa36.29■■■■□ 3.4
MCRIP1-208ENST00000575061 TRIM41Q8WV44 630 aa36.27■■■■□ 3.4
MCRIP1-208ENST00000575061 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.24■■■■□ 3.39
MCRIP1-208ENST00000575061 SOGA1O94964 1423 aa36.24■■■■□ 3.39
MCRIP1-208ENST00000575061 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
MCRIP1-208ENST00000575061 WDR97A6NE52 1622 aa36.14■■■■□ 3.38
MCRIP1-208ENST00000575061 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.13■■■■□ 3.37
MCRIP1-208ENST00000575061 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.09■■■■□ 3.37
MCRIP1-208ENST00000575061 KIF27Q86VH2 1401 aa35.91■■■■□ 3.34
MCRIP1-208ENST00000575061 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
MCRIP1-208ENST00000575061 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.87■■■■□ 3.33
MCRIP1-208ENST00000575061 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
MCRIP1-208ENST00000575061 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
MCRIP1-208ENST00000575061 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.84■■■■□ 3.33
MCRIP1-208ENST00000575061 EEA1Q15075 1411 aa35.82■■■■□ 3.32
MCRIP1-208ENST00000575061 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.79■■■■□ 3.323e-6■■■□□ 17.5
MCRIP1-208ENST00000575061 GRIN2BQ13224 1484 aa35.77■■■■□ 3.32
MCRIP1-208ENST00000575061 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.74■■■■□ 3.31
MCRIP1-208ENST00000575061 PBRM1Q86U86 1689 aa35.68■■■■□ 3.3
MCRIP1-208ENST00000575061 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
MCRIP1-208ENST00000575061 IGF1RP08069 1367 aa35.6■■■■□ 3.29
MCRIP1-208ENST00000575061 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.57■■■■□ 3.28
MCRIP1-208ENST00000575061 CUL7Q14999 1698 aa35.56■■■■□ 3.28
MCRIP1-208ENST00000575061 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.53■■■■□ 3.28
MCRIP1-208ENST00000575061 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.5■■■■□ 3.27
MCRIP1-208ENST00000575061 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.49■■■■□ 3.27
MCRIP1-208ENST00000575061 ADAMTS12P58397 1594 aa35.47■■■■□ 3.27
MCRIP1-208ENST00000575061 SYNJ2O15056 1496 aa35.45■■■■□ 3.27
MCRIP1-208ENST00000575061 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.41■■■■□ 3.26
MCRIP1-208ENST00000575061 PRXQ9BXM0 1461 aa35.37■■■■□ 3.25
MCRIP1-208ENST00000575061 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
MCRIP1-208ENST00000575061 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.32■■■■□ 3.24
MCRIP1-208ENST00000575061 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
MCRIP1-208ENST00000575061 GRIN2AQ12879 1464 aa35.28■■■■□ 3.24
MCRIP1-208ENST00000575061 KIF21BO75037 1637 aa35.27■■■■□ 3.24
MCRIP1-208ENST00000575061 CHD1O14646 1710 aa35.22■■■■□ 3.23
MCRIP1-208ENST00000575061 FBLN2P98095 1184 aa35.19■■■■□ 3.22
MCRIP1-208ENST00000575061 NUP160Q12769 1436 aa35.12■■■■□ 3.21
MCRIP1-208ENST00000575061 GOLGA3Q08378 1498 aa35.1■■■■□ 3.21
MCRIP1-208ENST00000575061 OSCARQ8IYS5 282 aa35.09■■■■□ 3.21
MCRIP1-208ENST00000575061 CEP170Q5SW79 1584 aa35■■■■□ 3.19
MCRIP1-208ENST00000575061 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.98■■■■□ 3.19
MCRIP1-208ENST00000575061 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms