RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575090.1

MCRIP1-209, Transcript of MAPK regulated corepressor interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MCRIP1, Length 752 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1-209ENST00000575090 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.56■■■■■ 6.49
MCRIP1-209ENST00000575090 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.47■■■■■ 5.51
MCRIP1-209ENST00000575090 ABCC9O60706 1549 aa48.98■■■■■ 5.43
MCRIP1-209ENST00000575090 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.86■■■■■ 5.09
MCRIP1-209ENST00000575090 NACADO15069 1562 aa46.72■■■■■ 5.07
MCRIP1-209ENST00000575090 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.7■■■■■ 5.07
MCRIP1-209ENST00000575090 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.33■■■■■ 5.01
MCRIP1-209ENST00000575090 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.17■■■■■ 4.98
MCRIP1-209ENST00000575090 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.95■■■■■ 4.95
MCRIP1-209ENST00000575090 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.78■■■■■ 4.922e-6■■□□□ 13.8
MCRIP1-209ENST00000575090 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.66■■■■■ 4.9
MCRIP1-209ENST00000575090 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.51■■■■■ 4.88
MCRIP1-209ENST00000575090 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.49■■■■■ 4.87
MCRIP1-209ENST00000575090 SCRIBQ14160 1630 aa45.14■■■■■ 4.82
MCRIP1-209ENST00000575090 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.96■■■■■ 4.79
MCRIP1-209ENST00000575090 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
MCRIP1-209ENST00000575090 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.24■■■■■ 4.67
MCRIP1-209ENST00000575090 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.07■■■■■ 4.65
MCRIP1-209ENST00000575090 NCAPD3P42695 1498 aa43.19■■■■■ 4.51
MCRIP1-209ENST00000575090 SMARCA4P51532 1647 aa43.15■■■■■ 4.5
MCRIP1-209ENST00000575090 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.13■■■■■ 4.49
MCRIP1-209ENST00000575090 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
MCRIP1-209ENST00000575090 SMARCA2P51531 1590 aa42.99■■■■■ 4.47
MCRIP1-209ENST00000575090 HMGXB3Q12766 1538 aa42.84■■■■■ 4.45
MCRIP1-209ENST00000575090 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.82■■■■■ 4.44
MCRIP1-209ENST00000575090 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.78■■■■■ 4.44
MCRIP1-209ENST00000575090 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
MCRIP1-209ENST00000575090 WIZO95785 1651 aa42.26■■■■■ 4.36
MCRIP1-209ENST00000575090 NESP48681 1621 aa42.25■■■■■ 4.35
MCRIP1-209ENST00000575090 ERCC6Q03468 1493 aa42.23■■■■■ 4.35
MCRIP1-209ENST00000575090 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
MCRIP1-209ENST00000575090 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.03■■■■■ 4.32
MCRIP1-209ENST00000575090 CUX2O14529 1486 aa41.96■■■■■ 4.31
MCRIP1-209ENST00000575090 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.91■■■■■ 4.3
MCRIP1-209ENST00000575090 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.84■■■■■ 4.29
MCRIP1-209ENST00000575090 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
MCRIP1-209ENST00000575090 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
MCRIP1-209ENST00000575090 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.61■■■■■ 4.25
MCRIP1-209ENST00000575090 CFTRP13569 1480 aa41.54■■■■■ 4.24
MCRIP1-209ENST00000575090 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.4■■■■■ 4.22
MCRIP1-209ENST00000575090 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.4■■■■■ 4.22
MCRIP1-209ENST00000575090 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.39■■■■■ 4.22
MCRIP1-209ENST00000575090 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.34■■■■■ 4.21
MCRIP1-209ENST00000575090 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.33■■■■■ 4.21
MCRIP1-209ENST00000575090 WDR62O43379 1518 aa41.26■■■■■ 4.2
MCRIP1-209ENST00000575090 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
MCRIP1-209ENST00000575090 PRDM2Q13029 1718 aa40.95■■■■■ 4.15
MCRIP1-209ENST00000575090 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
MCRIP1-209ENST00000575090 TOPBP1Q92547 1522 aa40.66■■■■■ 4.1
MCRIP1-209ENST00000575090 ABCC8Q09428 1581 aa40.64■■■■■ 4.1
MCRIP1-209ENST00000575090 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.53■■■■■ 4.08
MCRIP1-209ENST00000575090 IFT140Q96RY7 1462 aa40.53■■■■■ 4.08
MCRIP1-209ENST00000575090 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
MCRIP1-209ENST00000575090 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
MCRIP1-209ENST00000575090 OSCARQ8IYS5 282 aa40.24■■■■■ 4.03
MCRIP1-209ENST00000575090 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
MCRIP1-209ENST00000575090 CUX1P39880 1505 aa40.18■■■■■ 4.02
MCRIP1-209ENST00000575090 SOGA1O94964 1423 aa40.16■■■■■ 4.02
MCRIP1-209ENST00000575090 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.14■■■■■ 4.02
MCRIP1-209ENST00000575090 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.14■■■■■ 4.02
MCRIP1-209ENST00000575090 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
MCRIP1-209ENST00000575090 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.12■■■■■ 4.01
MCRIP1-209ENST00000575090 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
MCRIP1-209ENST00000575090 WDR97A6NE52 1622 aa39.84■■■■□ 3.97
MCRIP1-209ENST00000575090 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.78■■■■□ 3.96
MCRIP1-209ENST00000575090 FBLN2P98095 1184 aa39.76■■■■□ 3.96
MCRIP1-209ENST00000575090 TRIM41Q8WV44 630 aa39.72■■■■□ 3.95
MCRIP1-209ENST00000575090 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.71■■■■□ 3.95
MCRIP1-209ENST00000575090 GRIN2BQ13224 1484 aa39.71■■■■□ 3.95
MCRIP1-209ENST00000575090 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.7■■■■□ 3.95
MCRIP1-209ENST00000575090 TOP2BQ02880 1626 aa39.68■■■■□ 3.94
MCRIP1-209ENST00000575090 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.66■■■■□ 3.94
MCRIP1-209ENST00000575090 SYNJ1O43426 1573 aa39.64■■■■□ 3.94
MCRIP1-209ENST00000575090 CHD1O14646 1710 aa39.64■■■■□ 3.94
MCRIP1-209ENST00000575090 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.64■■■■□ 3.94
MCRIP1-209ENST00000575090 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.94
MCRIP1-209ENST00000575090 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
MCRIP1-209ENST00000575090 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.53■■■■□ 3.92
MCRIP1-209ENST00000575090 SYNJ2O15056 1496 aa39.5■■■■□ 3.91
MCRIP1-209ENST00000575090 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.49■■■■□ 3.91
MCRIP1-209ENST00000575090 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.49■■■■□ 3.91
MCRIP1-209ENST00000575090 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.49■■■■□ 3.91
MCRIP1-209ENST00000575090 ARHGEF11O15085 1522 aa39.48■■■■□ 3.91
MCRIP1-209ENST00000575090 PBRM1Q86U86 1689 aa39.45■■■■□ 3.91
MCRIP1-209ENST00000575090 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.31■■■■□ 3.88
MCRIP1-209ENST00000575090 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.25■■■■□ 3.87
MCRIP1-209ENST00000575090 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.21■■■■□ 3.87
MCRIP1-209ENST00000575090 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.2■■■■□ 3.87
MCRIP1-209ENST00000575090 GRIN2AQ12879 1464 aa39.19■■■■□ 3.86
MCRIP1-209ENST00000575090 ADAMTS12P58397 1594 aa39.18■■■■□ 3.86
MCRIP1-209ENST00000575090 ARAP1Q96P48 1450 aa39.15■■■■□ 3.86
MCRIP1-209ENST00000575090 NUP160Q12769 1436 aa39.06■■■■□ 3.84
MCRIP1-209ENST00000575090 KIF27Q86VH2 1401 aa38.99■■■■□ 3.83
MCRIP1-209ENST00000575090 CEP170Q5SW79 1584 aa38.98■■■■□ 3.83
MCRIP1-209ENST00000575090 IGF1RP08069 1367 aa38.95■■■■□ 3.83
MCRIP1-209ENST00000575090 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.75■■■■□ 3.79
MCRIP1-209ENST00000575090 SHROOM2Q13796 1616 aa38.74■■■■□ 3.79
MCRIP1-209ENST00000575090 JPH4Q96JJ6 628 aa38.73■■■■□ 3.79
MCRIP1-209ENST00000575090 CUL7Q14999 1698 aa38.69■■■■□ 3.78
MCRIP1-209ENST00000575090 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.69■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms