Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 HBM-202ENST00000472539 592 ntTSL 523.04■■□□□ 1.281e-323■■■■■ 148.2
PCBP1Q15365 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 11e-323■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 PPDPF-203ENST00000464438 373 ntTSL 220.69■□□□□ 0.91e-323■■■□□ 18.7
PCBP1Q15365 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-323■■■■■ 148.2
PCBP1Q15365 HBA1-203ENST00000472694 674 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.741e-323■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 HBA2-203ENST00000482565 640 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.741e-323■■■■■ 77.4
PCBP1Q15365 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.691e-323■■■■■ 77.4
PCBP1Q15365 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-323■■■■■ 84.4
PCBP1Q15365 SERPINA1-217ENST00000557118 583 ntTSL 414.99□□□□□ -0.011e-323■■□□□ 11.9
PCBP1Q15365 HBA2-202ENST00000397806 513 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-323■■■■■ 77.4
PCBP1Q15365 SERPINA1-211ENST00000553327 581 ntTSL 312.48□□□□□ -0.411e-323■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 HBA1-202ENST00000397797 504 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.641e-323■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 AC132217.1-201ENST00000430034 373 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.871e-323■■■□□ 17.3
PCBP1Q15365 A2M-203ENST00000462568 546 ntTSL 24.13□□□□□ -1.751e-323■■□□□ 13.9
PCBP1Q15365 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.771e-323■■■■■ 96.9
PCBP1Q15365 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.396e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-206ENST00000530019 550 ntTSL 417.48■□□□□ 0.396e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.396e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-210ENST00000534180 983 ntTSL 215.1■□□□□ 0.016e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.166e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-208ENST00000532829 912 ntTSL 214.05□□□□□ -0.166e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-203ENST00000529191 530 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.416e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-212ENST00000620041 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.936e-88■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 FTH1-207ENST00000532601 742 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -11e-87■■■■■ 45.8
PCBP1Q15365 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.368e-79■■■■■ 44.5
PCBP1Q15365 RPL10-212ENST00000479366 569 ntTSL 414.78□□□□□ -0.045e-78■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 A2M-211ENST00000543436 600 ntTSL 512.63□□□□□ -0.392e-76■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 SNRPA-202ENST00000596860 336 ntTSL 29.71□□□□□ -0.864e-76■■■■■ 65.8
PCBP1Q15365 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.177e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-204ENST00000392219 872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.547e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-205ENST00000423817 892 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.587e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-210ENST00000588699 927 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.697e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-211ENST00000590686 862 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.77e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-202ENST00000392217 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.727e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-212ENST00000591716 682 ntTSL 310.47□□□□□ -0.737e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-209ENST00000586925 429 ntTSL 310.47□□□□□ -0.737e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.037e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-213ENST00000592290 883 ntTSL 38.31□□□□□ -1.087e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.52■□□□□ 0.721e-71■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.14■□□□□ 0.651e-71■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 214.6□□□□□ -0.078e-71■□□□□ 8
PCBP1Q15365 FTH1-211ENST00000534719 788 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.031e-70■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 FTH1-209ENST00000533138 885 ntTSL 512.57□□□□□ -0.41e-70■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 FTH1-204ENST00000529548 567 ntTSL 311.25□□□□□ -0.611e-70■□□□□ 10.6
PCBP1Q15365 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-69■■■■■ 31
PCBP1Q15365 CALR-204ENST00000586967 394 ntTSL 216.24■□□□□ 0.195e-69■■■■■ 31
PCBP1Q15365 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 213.25□□□□□ -0.295e-69■■■■■ 31
PCBP1Q15365 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-68■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.362e-68■■■□□ 16
PCBP1Q15365 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.772e-68■■■■■ 29.9
PCBP1Q15365 INS-IGF2-201ENST00000356578 1706 ntTSL 519.22■□□□□ 0.672e-68■■■■■ 29.9
PCBP1Q15365 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.122e-68■■■■■ 29.9
PCBP1Q15365 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.472e-68■■■■■ 29.9
PCBP1Q15365 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-68■■□□□ 13
PCBP1Q15365 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.741e-67■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.71e-67■■□□□ 11.6
PCBP1Q15365 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)23.47■■□□□ 1.359e-66■■■■■ 28.1
PCBP1Q15365 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.219e-66■■■■■ 27.6
PCBP1Q15365 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 221.6■■□□□ 1.059e-66■■■■■ 27.6
PCBP1Q15365 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.959e-66■■■■■ 27.6
PCBP1Q15365 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 214.92□□□□□ -0.029e-66■■■■■ 27.6
PCBP1Q15365 WBP2-209ENST00000589236 747 ntTSL 214.58□□□□□ -0.081e-65■■■■■ 42.3
PCBP1Q15365 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.271e-64■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AL512328.1-201ENST00000412344 536 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.516e-64■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.075e-63■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.434e-62■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.344e-62■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.264e-62■□□□□ 11.3
PCBP1Q15365 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.521e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.771e-61■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 SERPINA1-215ENST00000556955 571 ntTSL 415.39■□□□□ 0.051e-61■□□□□ 10.7
PCBP1Q15365 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.316e-61■□□□□ 10.4
PCBP1Q15365 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.233e-56■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.063e-56■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 UCP2-208ENST00000544615 1004 ntTSL 211.12□□□□□ -0.633e-56■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 HMGA1-206ENST00000478214 716 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.356e-54■■■■□ 20.5
PCBP1Q15365 SRRM2-206ENST00000571041 498 ntTSL 416.96■□□□□ 0.311e-53■■■■■ 30.7
PCBP1Q15365 SRRM2-204ENST00000570705 675 ntTSL 316.84■□□□□ 0.291e-53■■■■■ 30.7
PCBP1Q15365 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.76e-53■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.876e-53■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.876e-53■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.896e-53■□□□□ 10.5
PCBP1Q15365 A2M-209ENST00000539638 590 ntTSL 45.9□□□□□ -1.462e-52■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 A2M-202ENST00000404455 623 ntTSL 55.9□□□□□ -1.462e-52■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 A2M-204ENST00000467091 533 ntTSL 53.59□□□□□ -1.832e-52■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 A2M-208ENST00000497324 533 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-52■□□□□ 8.8
PCBP1Q15365 ALDOA-215ENST00000565355 538 ntTSL 517.24■□□□□ 0.359e-52■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 ALDOA-217ENST00000566130 801 ntTSL 215.65■□□□□ 0.19e-52■■□□□ 12.6
PCBP1Q15365 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.44■□□□□ 0.062e-51■■■■■ 154.9
PCBP1Q15365 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt12.35□□□□□ -0.432e-51■■■■■ 154.9
PCBP1Q15365 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt12.18□□□□□ -0.462e-51■■■■■ 154.9
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