RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519070.5

FAM49B-211, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM49B, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM49B-211ENST00000519070 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.98■■■□□ 2.55
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FAM49B-211ENST00000519070 SMARCA2P51531 1590 aa30.32■■■□□ 2.44
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FAM49B-211ENST00000519070 CUX2O14529 1486 aa29.14■■■□□ 2.26
FAM49B-211ENST00000519070 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.13■■■□□ 2.25
FAM49B-211ENST00000519070 PRDM2Q13029 1718 aa29.08■■■□□ 2.25
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FAM49B-211ENST00000519070 TOPBP1Q92547 1522 aa28.7■■■□□ 2.19
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FAM49B-211ENST00000519070 ABCC8Q09428 1581 aa28.62■■■□□ 2.17
FAM49B-211ENST00000519070 CUX1P39880 1505 aa28.53■■■□□ 2.16
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FAM49B-211ENST00000519070 IFT140Q96RY7 1462 aa28.46■■■□□ 2.15
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FAM49B-211ENST00000519070 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.35■■■□□ 2.13
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FAM49B-211ENST00000519070 TOP2BQ02880 1626 aa28.27■■■□□ 2.12
FAM49B-211ENST00000519070 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
FAM49B-211ENST00000519070 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.24■■■□□ 2.11
FAM49B-211ENST00000519070 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
FAM49B-211ENST00000519070 WDR97A6NE52 1622 aa28.21■■■□□ 2.11
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FAM49B-211ENST00000519070 GRIN2BQ13224 1484 aa27.96■■■□□ 2.07
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FAM49B-211ENST00000519070 PBRM1Q86U86 1689 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM49B-211ENST00000519070 OSCARQ8IYS5 282 aa27.89■■■□□ 2.06
FAM49B-211ENST00000519070 CHD1O14646 1710 aa27.89■■■□□ 2.05
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FAM49B-211ENST00000519070 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.77■■■□□ 2.04
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FAM49B-211ENST00000519070 FBLN2P98095 1184 aa27.71■■■□□ 2.03
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FAM49B-211ENST00000519070 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.65■■■□□ 2.02
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FAM49B-211ENST00000519070 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.52■■■□□ 2
FAM49B-211ENST00000519070 ARHGEF11O15085 1522 aa27.51■■■□□ 2
FAM49B-211ENST00000519070 CUL7Q14999 1698 aa27.49■■□□□ 1.99
FAM49B-211ENST00000519070 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.42■■□□□ 1.98
FAM49B-211ENST00000519070 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.38■■□□□ 1.97
FAM49B-211ENST00000519070 SHROOM2Q13796 1616 aa27.35■■□□□ 1.97
FAM49B-211ENST00000519070 ARAP1Q96P48 1450 aa27.33■■□□□ 1.97
FAM49B-211ENST00000519070 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.3■■□□□ 1.96
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