RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446996.5

APOE-204, Transcript of apolipoprotein E, humanhuman

TSL 2

Gene APOE, Length 737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOE-204ENST00000446996 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.99■■■■■ 6.07
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APOE-204ENST00000446996 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
APOE-204ENST00000446996 NACADO15069 1562 aa44.18■■■■■ 4.66
APOE-204ENST00000446996 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.14■■■■■ 4.66
APOE-204ENST00000446996 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.09■■■■■ 4.65
APOE-204ENST00000446996 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.04■■■■■ 4.64
APOE-204ENST00000446996 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.96■■■■■ 4.63
APOE-204ENST00000446996 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.11■■■■■ 4.49
APOE-204ENST00000446996 SCRIBQ14160 1630 aa42.79■■■■■ 4.44
APOE-204ENST00000446996 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.75■■■■■ 4.43
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APOE-204ENST00000446996 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.47■■■■■ 4.39
APOE-204ENST00000446996 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.2■■■■■ 4.35
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APOE-204ENST00000446996 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.36■■■■■ 4.21
APOE-204ENST00000446996 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.18■■■■■ 4.18
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APOE-204ENST00000446996 SMARCA4P51532 1647 aa41.04■■■■■ 4.16
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APOE-204ENST00000446996 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.77■■■■■ 4.12
APOE-204ENST00000446996 SMARCA2P51531 1590 aa40.77■■■■■ 4.12
APOE-204ENST00000446996 NCAPD3P42695 1498 aa40.77■■■■■ 4.12
APOE-204ENST00000446996 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.72■■■■■ 4.11
APOE-204ENST00000446996 HMGXB3Q12766 1538 aa40.57■■■■■ 4.09
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APOE-204ENST00000446996 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
APOE-204ENST00000446996 WIZO95785 1651 aa40.35■■■■■ 4.05
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APOE-204ENST00000446996 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.57■■■■□ 3.92
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APOE-204ENST00000446996 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.15■■■■□ 3.86
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APOE-204ENST00000446996 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.9■■■■□ 3.82
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APOE-204ENST00000446996 TOPBP1Q92547 1522 aa38.48■■■■□ 3.75
APOE-204ENST00000446996 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.47■■■■□ 3.75
APOE-204ENST00000446996 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.47■■■■□ 3.75
APOE-204ENST00000446996 CUX1P39880 1505 aa38.25■■■■□ 3.71
APOE-204ENST00000446996 IFT140Q96RY7 1462 aa38.21■■■■□ 3.71
APOE-204ENST00000446996 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
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APOE-204ENST00000446996 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.04■■■■□ 3.68
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APOE-204ENST00000446996 SYNJ1O43426 1573 aa37.97■■■■□ 3.67
APOE-204ENST00000446996 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.94■■■■□ 3.66
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APOE-204ENST00000446996 WDR97A6NE52 1622 aa37.87■■■■□ 3.65
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APOE-204ENST00000446996 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.79■■■■□ 3.64
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APOE-204ENST00000446996 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.58■■■■□ 3.61
APOE-204ENST00000446996 GRIN2BQ13224 1484 aa37.57■■■■□ 3.6
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APOE-204ENST00000446996 CEP170Q5SW79 1584 aa36.83■■■■□ 3.49
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APOE-204ENST00000446996 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.71■■■■□ 3.47
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APOE-204ENST00000446996 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.7■■■■□ 3.47
APOE-204ENST00000446996 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.7■■■■□ 3.47
APOE-204ENST00000446996 ARHGEF11O15085 1522 aa36.7■■■■□ 3.47
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