Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 954.5
PCBP1Q15365 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-9■■■■■ 157.2
PCBP1Q15365 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.44■□□□□ 0.062e-51■■■■■ 154.9
PCBP1Q15365 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt12.35□□□□□ -0.432e-51■■■■■ 154.9
PCBP1Q15365 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt12.18□□□□□ -0.462e-51■■■■■ 154.9
PCBP1Q15365 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.26□□□□□ -1.254e-25■■■■■ 148.9
PCBP1Q15365 HBM-202ENST00000472539 592 ntTSL 523.04■■□□□ 1.281e-323■■■■■ 148.2
PCBP1Q15365 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-323■■■■■ 148.2
PCBP1Q15365 GET4-203ENST00000412734 873 ntTSL 216.41■□□□□ 0.227e-49■■■■■ 132.1
PCBP1Q15365 CTDNEP1-202ENST00000570380 506 ntTSL 511.61□□□□□ -0.551e-17■■■■■ 119.3
PCBP1Q15365 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.462e-12■■■■■ 109
PCBP1Q15365 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.38e-26■■■■■ 107.1
PCBP1Q15365 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.258e-26■■■■■ 107.1
PCBP1Q15365 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.898e-26■■■■■ 107.1
PCBP1Q15365 COX6B1-203ENST00000590618 290 ntTSL 37.68□□□□□ -1.188e-26■■■■■ 107.1
PCBP1Q15365 GRINA-207ENST00000531992 597 ntTSL 220.53■□□□□ 0.883e-35■■■■■ 101.8
PCBP1Q15365 SLC38A10-206ENST00000540966 896 ntTSL 318.81■□□□□ 0.64e-34■■■■■ 100.6
PCBP1Q15365 SLC38A10-211ENST00000576151 774 ntTSL 217.5■□□□□ 0.394e-34■■■■■ 100.6
PCBP1Q15365 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.054e-34■■■■■ 100.6
PCBP1Q15365 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 214.7□□□□□ -0.064e-34■■■■■ 100.6
PCBP1Q15365 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.82e-12■■■■■ 98.1
PCBP1Q15365 C19orf47-201ENST00000357884 1774 ntTSL 518.08■□□□□ 0.482e-12■■■■■ 98.1
PCBP1Q15365 C19orf47-207ENST00000582734 1977 ntTSL 217.37■□□□□ 0.372e-12■■■■■ 98.1
PCBP1Q15365 C19orf47-209ENST00000584868 583 ntTSL 216.2■□□□□ 0.182e-12■■■■■ 98.1
PCBP1Q15365 C19orf47-203ENST00000577617 550 ntTSL 316.05■□□□□ 0.162e-12■■■■■ 98.1
PCBP1Q15365 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-12■■■■■ 98.1
PCBP1Q15365 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.741e-11■■■■■ 97.4
PCBP1Q15365 MMP25-AS1-207ENST00000573878 483 ntTSL 315.12■□□□□ 0.011e-11■■■■■ 97.4
PCBP1Q15365 MMP25-AS1-205ENST00000572930 420 ntTSL 310.22□□□□□ -0.771e-11■■■■■ 97.4
PCBP1Q15365 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.141e-11■■■■■ 97.4
PCBP1Q15365 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.771e-323■■■■■ 96.9
PCBP1Q15365 GRINA-203ENST00000525513 796 ntTSL 517.39■□□□□ 0.374e-35■■■■■ 94.8
PCBP1Q15365 GRINA-210ENST00000534791 1050 ntTSL 511.73□□□□□ -0.534e-35■■■■■ 94.8
PCBP1Q15365 GRINA-208ENST00000533044 564 ntTSL 310.51□□□□□ -0.734e-35■■■■■ 94.8
PCBP1Q15365 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.869e-14■■■■■ 93.4
PCBP1Q15365 OXA1L-204ENST00000431881 889 ntTSL 317.88■□□□□ 0.459e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.379e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.229e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-205ENST00000442110 691 ntTSL 516.27■□□□□ 0.29e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.139e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.059e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-208ENST00000483939 1224 ntTSL 214.91□□□□□ -0.029e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-209ENST00000495424 1679 ntTSL 213.59□□□□□ -0.239e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-206ENST00000473744 824 ntTSL 312.85□□□□□ -0.359e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-210ENST00000556473 593 ntTSL 411.96□□□□□ -0.499e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-213ENST00000612549 2971 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.699e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 OXA1L-207ENST00000481218 1596 ntTSL 58.88□□□□□ -0.999e-12■■■■■ 92.4
PCBP1Q15365 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.674e-15■■■■■ 90.5
PCBP1Q15365 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.811e-10■■■■■ 88
PCBP1Q15365 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.631e-10■■■■■ 88
PCBP1Q15365 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.441e-10■■■■■ 88
PCBP1Q15365 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.034e-13■■■■■ 85.6
PCBP1Q15365 G6PC3-202ENST00000585361 1572 ntTSL 219.57■□□□□ 0.724e-13■■■■■ 85.6
PCBP1Q15365 G6PC3-204ENST00000588558 1718 ntTSL 1 (best)19.31■□□□□ 0.684e-13■■■■■ 85.6
PCBP1Q15365 G6PC3-205ENST00000590253 844 ntTSL 517.71■□□□□ 0.434e-13■■■■■ 85.6
PCBP1Q15365 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.746e-9■■■■■ 84.5
PCBP1Q15365 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.426e-9■■■■■ 84.5
PCBP1Q15365 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-323■■■■■ 84.4
PCBP1Q15365 GRINA-205ENST00000529301 1075 ntTSL 322.7■■□□□ 1.222e-31■■■■■ 83.8
PCBP1Q15365 GRINA-206ENST00000530898 558 ntTSL 217.47■□□□□ 0.392e-31■■■■■ 83.8
PCBP1Q15365 U2AF2-205ENST00000588850 637 ntTSL 216.83■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 83.1
PCBP1Q15365 ACLY-209ENST00000590770 583 ntTSL 413.81□□□□□ -0.23e-12■■■■■ 83
PCBP1Q15365 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.423e-12■■■■■ 83
PCBP1Q15365 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.63e-12■■■■■ 83
PCBP1Q15365 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.883e-12■■■■■ 83
PCBP1Q15365 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.973e-12■■■■■ 83
PCBP1Q15365 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-12■■■■■ 83
PCBP1Q15365 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.231e-6■■■■■ 81.9
PCBP1Q15365 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.269e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-213ENST00000532085 5862 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.159e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.069e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-218ENST00000638186 2074 ntTSL 514.85□□□□□ -0.039e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-205ENST00000525102 2844 ntTSL 214.77□□□□□ -0.049e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-220ENST00000638925 2046 ntTSL 514.62□□□□□ -0.079e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.179e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-219ENST00000638360 1912 ntTSL 514□□□□□ -0.179e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.189e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-210ENST00000527992 2040 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.249e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 SLC37A4-208ENST00000526275 2626 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.549e-12■■■■■ 81.5
PCBP1Q15365 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 414.71□□□□□ -0.054e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.214e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.44e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.964e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 27.89□□□□□ -1.154e-24■■■■■ 81.4
PCBP1Q15365 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-223ENST00000544669 1800 ntTSL 513.61□□□□□ -0.231e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-211ENST00000477890 1234 ntTSL 513.08□□□□□ -0.321e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-218ENST00000537641 1728 ntTSL 512.28□□□□□ -0.441e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.071e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-214ENST00000535222 940 ntTSL 38.37□□□□□ -1.071e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 CPSF7-219ENST00000539952 953 ntTSL 56.64□□□□□ -1.351e-15■■■■■ 80.2
PCBP1Q15365 MIEN1-202ENST00000469568 825 ntTSL 222.78■■□□□ 1.244e-14■■■■■ 80.1
PCBP1Q15365 MIEN1-204ENST00000498164 925 ntTSL 222.78■■□□□ 1.244e-14■■■■■ 80.1
PCBP1Q15365 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.924e-14■■■■■ 80.1
PCBP1Q15365 MIEN1-206ENST00000582963 1999 nt20.24■□□□□ 0.834e-14■■■■■ 80.1
PCBP1Q15365 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.674e-14■■■■■ 80.1
PCBP1Q15365 MIEN1-203ENST00000474210 706 ntTSL 218.49■□□□□ 0.554e-14■■■■■ 80.1
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