Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXT2Q93063 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXT2Q93063 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXT2Q93063 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms