RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.67■■■■■ 6.34
TMIE-201ENST00000326431 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.85■■■■■ 5.25
TMIE-201ENST00000326431 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
TMIE-201ENST00000326431 ABCC9O60706 1549 aa45.41■■■■■ 4.86
TMIE-201ENST00000326431 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.19■■■■■ 4.82
TMIE-201ENST00000326431 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.16■■■■■ 4.82
TMIE-201ENST00000326431 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.73■■■■■ 4.75
TMIE-201ENST00000326431 NACADO15069 1562 aa44.56■■■■■ 4.72
TMIE-201ENST00000326431 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.42■■■■■ 4.7
TMIE-201ENST00000326431 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.25■■■■■ 4.67
TMIE-201ENST00000326431 SCRIBQ14160 1630 aa43.96■■■■■ 4.63
TMIE-201ENST00000326431 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.51■■■■■ 4.56
TMIE-201ENST00000326431 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.97■■■■■ 4.47
TMIE-201ENST00000326431 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.74■■■■■ 4.43
TMIE-201ENST00000326431 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
TMIE-201ENST00000326431 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.51■■■■■ 4.4
TMIE-201ENST00000326431 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
TMIE-201ENST00000326431 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.24■■■■■ 4.35
TMIE-201ENST00000326431 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
TMIE-201ENST00000326431 SMARCA4P51532 1647 aa42.12■■■■■ 4.33
TMIE-201ENST00000326431 WIZO95785 1651 aa41.94■■■■■ 4.3
TMIE-201ENST00000326431 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
TMIE-201ENST00000326431 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.59■■■■■ 4.25
TMIE-201ENST00000326431 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
TMIE-201ENST00000326431 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.43■■■■■ 4.22
TMIE-201ENST00000326431 SMARCA2P51531 1590 aa41.41■■■■■ 4.22
TMIE-201ENST00000326431 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
TMIE-201ENST00000326431 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.13■■■■■ 4.17
TMIE-201ENST00000326431 NCAPD3P42695 1498 aa41.1■■■■■ 4.17
TMIE-201ENST00000326431 HMGXB3Q12766 1538 aa41.06■■■■■ 4.16
TMIE-201ENST00000326431 CCDC88BA6NC98 1476 aa41■■■■■ 4.15
TMIE-201ENST00000326431 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.63■■■■■ 4.1
TMIE-201ENST00000326431 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.23■■■■■ 4.03
TMIE-201ENST00000326431 CFTRP13569 1480 aa40.13■■■■■ 4.01
TMIE-201ENST00000326431 ABCC8Q09428 1581 aa40.11■■■■■ 4.01
TMIE-201ENST00000326431 PRDM2Q13029 1718 aa40.08■■■■■ 4.01
TMIE-201ENST00000326431 TRIM41Q8WV44 630 aa40.02■■■■■ 4
TMIE-201ENST00000326431 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.02■■■■■ 4
TMIE-201ENST00000326431 NESP48681 1621 aa39.81■■■■□ 3.96
TMIE-201ENST00000326431 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.81■■■■□ 3.96
TMIE-201ENST00000326431 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.79■■■■□ 3.96
TMIE-201ENST00000326431 SYNJ1O43426 1573 aa39.73■■■■□ 3.95
TMIE-201ENST00000326431 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.61■■■■□ 3.93
TMIE-201ENST00000326431 TOP2BQ02880 1626 aa39.57■■■■□ 3.93
TMIE-201ENST00000326431 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.57■■■■□ 3.92
TMIE-201ENST00000326431 CUX1P39880 1505 aa39.52■■■■□ 3.92
TMIE-201ENST00000326431 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.42■■■■□ 3.9
TMIE-201ENST00000326431 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.41■■■■□ 3.9
TMIE-201ENST00000326431 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.39■■■■□ 3.9
TMIE-201ENST00000326431 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
TMIE-201ENST00000326431 SOGA1O94964 1423 aa39.25■■■■□ 3.87
TMIE-201ENST00000326431 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.24■■■■□ 3.87
TMIE-201ENST00000326431 TOPBP1Q92547 1522 aa39.17■■■■□ 3.86
TMIE-201ENST00000326431 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
TMIE-201ENST00000326431 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.15■■■■□ 3.86
TMIE-201ENST00000326431 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.11■■■■□ 3.85
TMIE-201ENST00000326431 EEA1Q15075 1411 aa39.09■■■■□ 3.85
TMIE-201ENST00000326431 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.07■■■■□ 3.85
TMIE-201ENST00000326431 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.97■■■■□ 3.83
TMIE-201ENST00000326431 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
TMIE-201ENST00000326431 ERCC6Q03468 1493 aa38.93■■■■□ 3.82
TMIE-201ENST00000326431 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.89■■■■□ 3.82
TMIE-201ENST00000326431 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.83■■■■□ 3.81
TMIE-201ENST00000326431 KIF27Q86VH2 1401 aa38.81■■■■□ 3.8
TMIE-201ENST00000326431 WDR62O43379 1518 aa38.8■■■■□ 3.8
TMIE-201ENST00000326431 CUX2O14529 1486 aa38.79■■■■□ 3.8
TMIE-201ENST00000326431 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.79■■■■□ 3.8
TMIE-201ENST00000326431 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
TMIE-201ENST00000326431 WDR97A6NE52 1622 aa38.75■■■■□ 3.79
TMIE-201ENST00000326431 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.74■■■■□ 3.79
TMIE-201ENST00000326431 KIF21BO75037 1637 aa38.67■■■■□ 3.78
TMIE-201ENST00000326431 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
TMIE-201ENST00000326431 GOLGA3Q08378 1498 aa38.57■■■■□ 3.76
TMIE-201ENST00000326431 PRXQ9BXM0 1461 aa38.51■■■■□ 3.76
TMIE-201ENST00000326431 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.51■■■■□ 3.76
TMIE-201ENST00000326431 IGF1RP08069 1367 aa38.49■■■■□ 3.75
TMIE-201ENST00000326431 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.47■■■■□ 3.75
TMIE-201ENST00000326431 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
TMIE-201ENST00000326431 IFT140Q96RY7 1462 aa38.44■■■■□ 3.74
TMIE-201ENST00000326431 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.43■■■■□ 3.74
TMIE-201ENST00000326431 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.38■■■■□ 3.74
TMIE-201ENST00000326431 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.37■■■■□ 3.73
TMIE-201ENST00000326431 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
TMIE-201ENST00000326431 CUL7Q14999 1698 aa38.3■■■■□ 3.72
TMIE-201ENST00000326431 PBRM1Q86U86 1689 aa38.3■■■■□ 3.72
TMIE-201ENST00000326431 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.29■■■■□ 3.72
TMIE-201ENST00000326431 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
TMIE-201ENST00000326431 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.26■■■■□ 3.71
TMIE-201ENST00000326431 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
TMIE-201ENST00000326431 CEP162Q5TB80 1403 aa38.18■■■■□ 3.7
TMIE-201ENST00000326431 GRIN2BQ13224 1484 aa38.11■■■■□ 3.69
TMIE-201ENST00000326431 ADAMTS12P58397 1594 aa38.02■■■■□ 3.68
TMIE-201ENST00000326431 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.94■■■■□ 3.66
TMIE-201ENST00000326431 CLIP1P30622 1438 aa37.93■■■■□ 3.66
TMIE-201ENST00000326431 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.91■■■■□ 3.66
TMIE-201ENST00000326431 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.9■■■■□ 3.66
TMIE-201ENST00000326431 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
TMIE-201ENST00000326431 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
TMIE-201ENST00000326431 SYNJ2O15056 1496 aa37.68■■■■□ 3.62
TMIE-201ENST00000326431 GRIN2AQ12879 1464 aa37.67■■■■□ 3.62
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