RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222374.2

CADM4-201, Transcript of cell adhesion molecule 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CADM4, Length 2,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4-201ENST00000222374 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.16■■■■■ 6.1
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CADM4-201ENST00000222374 ABCC9O60706 1549 aa43.72■■■■■ 4.59
CADM4-201ENST00000222374 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.53■■■■■ 4.56
CADM4-201ENST00000222374 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.35■■■■■ 4.53
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CADM4-201ENST00000222374 SCRIBQ14160 1630 aa42.62■■■■■ 4.41
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CADM4-201ENST00000222374 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.31■■■■■ 4.04
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CADM4-201ENST00000222374 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.14■■■■■ 4.02
CADM4-201ENST00000222374 SMARCA2P51531 1590 aa40.12■■■■■ 4.01
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CADM4-201ENST00000222374 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.54■■■■□ 3.92
CADM4-201ENST00000222374 TRIM41Q8WV44 630 aa39.43■■■■□ 3.9
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CADM4-201ENST00000222374 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.9■■■■□ 3.82
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CADM4-201ENST00000222374 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.78■■■■□ 3.8
CADM4-201ENST00000222374 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
CADM4-201ENST00000222374 PRDM2Q13029 1718 aa38.71■■■■□ 3.79
CADM4-201ENST00000222374 SYNJ1O43426 1573 aa38.7■■■■□ 3.79
CADM4-201ENST00000222374 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.54■■■■□ 3.76
CADM4-201ENST00000222374 TOP2BQ02880 1626 aa38.53■■■■□ 3.76
CADM4-201ENST00000222374 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.47■■■■□ 3.75
CADM4-201ENST00000222374 SOGA1O94964 1423 aa38.45■■■■□ 3.75
CADM4-201ENST00000222374 NESP48681 1621 aa38.41■■■■□ 3.74
CADM4-201ENST00000222374 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.4■■■■□ 3.74
CADM4-201ENST00000222374 CUX1P39880 1505 aa38.4■■■■□ 3.74
CADM4-201ENST00000222374 EEA1Q15075 1411 aa38.36■■■■□ 3.73
CADM4-201ENST00000222374 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.36■■■■□ 3.73
CADM4-201ENST00000222374 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.29■■■■□ 3.72
CADM4-201ENST00000222374 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.24■■■■□ 3.71
CADM4-201ENST00000222374 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.19■■■■□ 3.7
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CADM4-201ENST00000222374 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.1■■■■□ 3.69
CADM4-201ENST00000222374 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.01■■■■□ 3.68
CADM4-201ENST00000222374 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.97■■■■□ 3.67
CADM4-201ENST00000222374 TOPBP1Q92547 1522 aa37.94■■■■□ 3.66
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CADM4-201ENST00000222374 KIF21BO75037 1637 aa37.85■■■■□ 3.65
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CADM4-201ENST00000222374 CUX2O14529 1486 aa37.77■■■■□ 3.64
CADM4-201ENST00000222374 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.76■■■■□ 3.63
CADM4-201ENST00000222374 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
CADM4-201ENST00000222374 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.73■■■■□ 3.63
CADM4-201ENST00000222374 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.67■■■■□ 3.62
CADM4-201ENST00000222374 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.65■■■■□ 3.62
CADM4-201ENST00000222374 PRXQ9BXM0 1461 aa37.64■■■■□ 3.62
CADM4-201ENST00000222374 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.63■■■■□ 3.61
CADM4-201ENST00000222374 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.6■■■■□ 3.61
CADM4-201ENST00000222374 CEP162Q5TB80 1403 aa37.59■■■■□ 3.61
CADM4-201ENST00000222374 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.58■■■■□ 3.61
CADM4-201ENST00000222374 IGF1RP08069 1367 aa37.54■■■■□ 3.6
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CADM4-201ENST00000222374 WDR97A6NE52 1622 aa37.47■■■■□ 3.59
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CADM4-201ENST00000222374 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.36■■■■□ 3.57
CADM4-201ENST00000222374 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
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CADM4-201ENST00000222374 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
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CADM4-201ENST00000222374 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.05■■■■□ 3.52
CADM4-201ENST00000222374 PBRM1Q86U86 1689 aa37.01■■■■□ 3.52
CADM4-201ENST00000222374 HRCP23327 699 aa37■■■■□ 3.51
CADM4-201ENST00000222374 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
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CADM4-201ENST00000222374 GRIN2BQ13224 1484 aa36.93■■■■□ 3.5
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CADM4-201ENST00000222374 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.85■■■■□ 3.49
CADM4-201ENST00000222374 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
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