RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409941.1

ECEL1-202, Transcript of endothelin converting enzyme like 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECEL1, Length 2,322 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECEL1-202ENST00000409941 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.74■■■■■ 5.87
ECEL1-202ENST00000409941 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.56■■■■■ 4.72
ECEL1-202ENST00000409941 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
ECEL1-202ENST00000409941 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.26■■■■■ 4.52
ECEL1-202ENST00000409941 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.16■■■■■ 4.5
ECEL1-202ENST00000409941 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.44■■■■■ 4.38
ECEL1-202ENST00000409941 ABCC9O60706 1549 aa42.24■■■■■ 4.35
ECEL1-202ENST00000409941 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
ECEL1-202ENST00000409941 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.63■■■■■ 4.25
ECEL1-202ENST00000409941 SCRIBQ14160 1630 aa41.59■■■■■ 4.25
ECEL1-202ENST00000409941 NACADO15069 1562 aa41.42■■■■■ 4.22
ECEL1-202ENST00000409941 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.01■■■■■ 4.16
ECEL1-202ENST00000409941 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
ECEL1-202ENST00000409941 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.48■■■■■ 4.07
ECEL1-202ENST00000409941 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.46■■■■■ 4.07
ECEL1-202ENST00000409941 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.19■■■■■ 4.02
ECEL1-202ENST00000409941 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.01
ECEL1-202ENST00000409941 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.12■■■■■ 4.01
ECEL1-202ENST00000409941 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.99■■■■□ 3.99
ECEL1-202ENST00000409941 WIZO95785 1651 aa39.94■■■■□ 3.98
ECEL1-202ENST00000409941 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
ECEL1-202ENST00000409941 SMARCA4P51532 1647 aa39.67■■■■□ 3.94
ECEL1-202ENST00000409941 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
ECEL1-202ENST00000409941 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.06■■■■□ 3.84
ECEL1-202ENST00000409941 TRIM41Q8WV44 630 aa39.03■■■■□ 3.84
ECEL1-202ENST00000409941 SMARCA2P51531 1590 aa39.03■■■■□ 3.84
ECEL1-202ENST00000409941 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.95■■■■□ 3.83
ECEL1-202ENST00000409941 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.91■■■■□ 3.82
ECEL1-202ENST00000409941 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.9■■■■□ 3.82
ECEL1-202ENST00000409941 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
ECEL1-202ENST00000409941 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
ECEL1-202ENST00000409941 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
ECEL1-202ENST00000409941 ABCC8Q09428 1581 aa38.63■■■■□ 3.77
ECEL1-202ENST00000409941 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.44■■■■□ 3.74
ECEL1-202ENST00000409941 NCAPD3P42695 1498 aa38.32■■■■□ 3.73
ECEL1-202ENST00000409941 HMGXB3Q12766 1538 aa38.25■■■■□ 3.71
ECEL1-202ENST00000409941 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.05■■■■□ 3.68
ECEL1-202ENST00000409941 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.05■■■■□ 3.68
ECEL1-202ENST00000409941 SOGA1O94964 1423 aa38■■■■□ 3.67
ECEL1-202ENST00000409941 SYNJ1O43426 1573 aa37.98■■■■□ 3.67
ECEL1-202ENST00000409941 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.9■■■■□ 3.66
ECEL1-202ENST00000409941 CFTRP13569 1480 aa37.71■■■■□ 3.63
ECEL1-202ENST00000409941 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.68■■■■□ 3.62
ECEL1-202ENST00000409941 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.6■■■■□ 3.61
ECEL1-202ENST00000409941 TOP2BQ02880 1626 aa37.58■■■■□ 3.61
ECEL1-202ENST00000409941 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.5■■■■□ 3.59
ECEL1-202ENST00000409941 EEA1Q15075 1411 aa37.49■■■■□ 3.59
ECEL1-202ENST00000409941 CUX1P39880 1505 aa37.49■■■■□ 3.59
ECEL1-202ENST00000409941 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.47■■■■□ 3.59
ECEL1-202ENST00000409941 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.47■■■■□ 3.59
ECEL1-202ENST00000409941 PRDM2Q13029 1718 aa37.41■■■■□ 3.58
ECEL1-202ENST00000409941 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
ECEL1-202ENST00000409941 NESP48681 1621 aa37.32■■■■□ 3.56
ECEL1-202ENST00000409941 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.55
ECEL1-202ENST00000409941 GOLGA3Q08378 1498 aa37.24■■■■□ 3.55
ECEL1-202ENST00000409941 CEP162Q5TB80 1403 aa37.24■■■■□ 3.55
ECEL1-202ENST00000409941 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.22■■■■□ 3.55
ECEL1-202ENST00000409941 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
ECEL1-202ENST00000409941 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.15■■■■□ 3.54
ECEL1-202ENST00000409941 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.15■■■■□ 3.54
ECEL1-202ENST00000409941 KIF21BO75037 1637 aa37.13■■■■□ 3.53
ECEL1-202ENST00000409941 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.13■■■■□ 3.53
ECEL1-202ENST00000409941 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.98■■■■□ 3.51
ECEL1-202ENST00000409941 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
ECEL1-202ENST00000409941 KIF27Q86VH2 1401 aa36.95■■■■□ 3.51
ECEL1-202ENST00000409941 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.89■■■■□ 3.5
ECEL1-202ENST00000409941 CUX2O14529 1486 aa36.88■■■■□ 3.5
ECEL1-202ENST00000409941 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
ECEL1-202ENST00000409941 PRXQ9BXM0 1461 aa36.87■■■■□ 3.49
ECEL1-202ENST00000409941 HRCP23327 699 aa36.82■■■■□ 3.48
ECEL1-202ENST00000409941 TOPBP1Q92547 1522 aa36.8■■■■□ 3.48
ECEL1-202ENST00000409941 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.79■■■■□ 3.48
ECEL1-202ENST00000409941 CLIP1P30622 1438 aa36.78■■■■□ 3.48
ECEL1-202ENST00000409941 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.77■■■■□ 3.48
ECEL1-202ENST00000409941 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.72■■■■□ 3.47
ECEL1-202ENST00000409941 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
ECEL1-202ENST00000409941 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
ECEL1-202ENST00000409941 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.7■■■■□ 3.47
ECEL1-202ENST00000409941 IGF1RP08069 1367 aa36.69■■■■□ 3.46
ECEL1-202ENST00000409941 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.64■■■■□ 3.46
ECEL1-202ENST00000409941 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.5■■■■□ 3.43
ECEL1-202ENST00000409941 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.5■■■■□ 3.43
ECEL1-202ENST00000409941 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.46■■■■□ 3.43
ECEL1-202ENST00000409941 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
ECEL1-202ENST00000409941 ARAP1Q96P48 1450 aa36.37■■■■□ 3.41
ECEL1-202ENST00000409941 WDR97A6NE52 1622 aa36.34■■■■□ 3.41
ECEL1-202ENST00000409941 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.25■■■■□ 3.39
ECEL1-202ENST00000409941 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.19■■■■□ 3.38
ECEL1-202ENST00000409941 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.18■■■■□ 3.38
ECEL1-202ENST00000409941 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
ECEL1-202ENST00000409941 APLP2Q06481 763 aa36.17■■■■□ 3.38
ECEL1-202ENST00000409941 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.16■■■■□ 3.38
ECEL1-202ENST00000409941 CUL7Q14999 1698 aa36.11■■■■□ 3.37
ECEL1-202ENST00000409941 P3H3Q8IVL6 736 aa36.07■■■■□ 3.37
ECEL1-202ENST00000409941 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.04■■■■□ 3.36
ECEL1-202ENST00000409941 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
ECEL1-202ENST00000409941 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
ECEL1-202ENST00000409941 ERCC6Q03468 1493 aa36■■■■□ 3.35
ECEL1-202ENST00000409941 WDR62O43379 1518 aa35.94■■■■□ 3.34
ECEL1-202ENST00000409941 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms