RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521951.1

PVT1-212, Transcript of Pvt1 oncogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PVT1, Length 1,535 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVT1-212ENST00000521951 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.16■■■■■ 6.74
PVT1-212ENST00000521951 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.41■■■■■ 5.66
PVT1-212ENST00000521951 ABCC9O60706 1549 aa48.59■■■■■ 5.37
PVT1-212ENST00000521951 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.77■■■■■ 5.24
PVT1-212ENST00000521951 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.49■■■■■ 5.19
PVT1-212ENST00000521951 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.29■■■■■ 5.16
PVT1-212ENST00000521951 NACADO15069 1562 aa47.21■■■■■ 5.15
PVT1-212ENST00000521951 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.17■■■■■ 5.14
PVT1-212ENST00000521951 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.06■■■■■ 5.12
PVT1-212ENST00000521951 SCRIBQ14160 1630 aa46.11■■■■■ 4.97
PVT1-212ENST00000521951 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.06■■■■■ 4.96
PVT1-212ENST00000521951 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.72■■■■■ 4.91
PVT1-212ENST00000521951 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.65■■■■■ 4.9
PVT1-212ENST00000521951 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.59■■■■■ 4.89
PVT1-212ENST00000521951 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.47■■■■■ 4.71
PVT1-212ENST00000521951 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
PVT1-212ENST00000521951 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
PVT1-212ENST00000521951 SMARCA4P51532 1647 aa44.17■■■■■ 4.66
PVT1-212ENST00000521951 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.09■■■■■ 4.65
PVT1-212ENST00000521951 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.98■■■■■ 4.63
PVT1-212ENST00000521951 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.91■■■■■ 4.62
PVT1-212ENST00000521951 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
PVT1-212ENST00000521951 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.73■■■■■ 4.59
PVT1-212ENST00000521951 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.7■■■■■ 4.59
PVT1-212ENST00000521951 SMARCA2P51531 1590 aa43.69■■■■■ 4.58
PVT1-212ENST00000521951 WIZO95785 1651 aa43.66■■■■■ 4.58
PVT1-212ENST00000521951 NCAPD3P42695 1498 aa43.56■■■■■ 4.56
PVT1-212ENST00000521951 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
PVT1-212ENST00000521951 HMGXB3Q12766 1538 aa43.41■■■■■ 4.54
PVT1-212ENST00000521951 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
PVT1-212ENST00000521951 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
PVT1-212ENST00000521951 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.73■■■■■ 4.43
PVT1-212ENST00000521951 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.35■■■■■ 4.37
PVT1-212ENST00000521951 NESP48681 1621 aa42.31■■■■■ 4.36
PVT1-212ENST00000521951 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.27■■■■■ 4.36
PVT1-212ENST00000521951 CFTRP13569 1480 aa42.26■■■■■ 4.36
PVT1-212ENST00000521951 PRDM2Q13029 1718 aa42.02■■■■■ 4.32
PVT1-212ENST00000521951 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.97■■■■■ 4.31
PVT1-212ENST00000521951 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.87■■■■■ 4.29
PVT1-212ENST00000521951 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.82■■■■■ 4.29
PVT1-212ENST00000521951 ERCC6Q03468 1493 aa41.79■■■■■ 4.28
PVT1-212ENST00000521951 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.72■■■■■ 4.27
PVT1-212ENST00000521951 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.48■■■■■ 4.23
PVT1-212ENST00000521951 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
PVT1-212ENST00000521951 ABCC8Q09428 1581 aa41.43■■■■■ 4.22
PVT1-212ENST00000521951 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
PVT1-212ENST00000521951 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.33■■■■■ 4.21
PVT1-212ENST00000521951 WDR62O43379 1518 aa41.31■■■■■ 4.2
PVT1-212ENST00000521951 CUX1P39880 1505 aa41.3■■■■■ 4.2
PVT1-212ENST00000521951 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.3■■■■■ 4.2
PVT1-212ENST00000521951 TOPBP1Q92547 1522 aa41.3■■■■■ 4.2
PVT1-212ENST00000521951 SYNJ1O43426 1573 aa41.2■■■■■ 4.19
PVT1-212ENST00000521951 TOP2BQ02880 1626 aa41.15■■■■■ 4.18
PVT1-212ENST00000521951 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.14■■■■■ 4.18
PVT1-212ENST00000521951 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.03■■■■■ 4.16
PVT1-212ENST00000521951 CUX2O14529 1486 aa41.02■■■■■ 4.16
PVT1-212ENST00000521951 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.02■■■■■ 4.16
PVT1-212ENST00000521951 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
PVT1-212ENST00000521951 TRIM41Q8WV44 630 aa40.97■■■■■ 4.15
PVT1-212ENST00000521951 SOGA1O94964 1423 aa40.86■■■■■ 4.13
PVT1-212ENST00000521951 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.85■■■■■ 4.13
PVT1-212ENST00000521951 IFT140Q96RY7 1462 aa40.8■■■■■ 4.12
PVT1-212ENST00000521951 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
PVT1-212ENST00000521951 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.65■■■■■ 4.1
PVT1-212ENST00000521951 WDR97A6NE52 1622 aa40.63■■■■■ 4.1
PVT1-212ENST00000521951 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
PVT1-212ENST00000521951 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
PVT1-212ENST00000521951 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.48■■■■■ 4.073e-7■■□□□ 11.6
PVT1-212ENST00000521951 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
PVT1-212ENST00000521951 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.42■■■■■ 4.06
PVT1-212ENST00000521951 KIF27Q86VH2 1401 aa40.4■■■■■ 4.06
PVT1-212ENST00000521951 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.39■■■■■ 4.06
PVT1-212ENST00000521951 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.35■■■■■ 4.05
PVT1-212ENST00000521951 GRIN2BQ13224 1484 aa40.25■■■■■ 4.03
PVT1-212ENST00000521951 PBRM1Q86U86 1689 aa40.25■■■■■ 4.03
PVT1-212ENST00000521951 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.17■■■■■ 4.02
PVT1-212ENST00000521951 IGF1RP08069 1367 aa40.17■■■■■ 4.02
PVT1-212ENST00000521951 EEA1Q15075 1411 aa40.16■■■■■ 4.02
PVT1-212ENST00000521951 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
PVT1-212ENST00000521951 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.1■■■■■ 4.01
PVT1-212ENST00000521951 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
PVT1-212ENST00000521951 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.05■■■■■ 4
PVT1-212ENST00000521951 CUL7Q14999 1698 aa39.97■■■■□ 3.99
PVT1-212ENST00000521951 ADAMTS12P58397 1594 aa39.97■■■■□ 3.99
PVT1-212ENST00000521951 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.94■■■■□ 3.98
PVT1-212ENST00000521951 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.94■■■■□ 3.98
PVT1-212ENST00000521951 SYNJ2O15056 1496 aa39.89■■■■□ 3.98
PVT1-212ENST00000521951 FBLN2P98095 1184 aa39.85■■■■□ 3.97
PVT1-212ENST00000521951 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
PVT1-212ENST00000521951 PRXQ9BXM0 1461 aa39.84■■■■□ 3.97
PVT1-212ENST00000521951 CHD1O14646 1710 aa39.8■■■■□ 3.96
PVT1-212ENST00000521951 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.78■■■■□ 3.96
PVT1-212ENST00000521951 GRIN2AQ12879 1464 aa39.74■■■■□ 3.95
PVT1-212ENST00000521951 KIF21BO75037 1637 aa39.69■■■■□ 3.94
PVT1-212ENST00000521951 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.57■■■■□ 3.93
PVT1-212ENST00000521951 OSCARQ8IYS5 282 aa39.53■■■■□ 3.92
PVT1-212ENST00000521951 NUP160Q12769 1436 aa39.53■■■■□ 3.92
PVT1-212ENST00000521951 CEP170Q5SW79 1584 aa39.53■■■■□ 3.92
PVT1-212ENST00000521951 GOLGA3Q08378 1498 aa39.52■■■■□ 3.92
PVT1-212ENST00000521951 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
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