RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381980.8

C4orf19-202, Transcript of chromosome 4 open reading frame 19, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf19, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf19-202ENST00000381980 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.99■■■■■ 5.91
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C4orf19-202ENST00000381980 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.96■■■■■ 4.47
C4orf19-202ENST00000381980 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.91■■■■■ 4.46
C4orf19-202ENST00000381980 ABCC9O60706 1549 aa42.26■■■■■ 4.36
C4orf19-202ENST00000381980 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.19■■■■■ 4.34
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C4orf19-202ENST00000381980 SCRIBQ14160 1630 aa41.62■■■■■ 4.25
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C4orf19-202ENST00000381980 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.39■■■■■ 4.06
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C4orf19-202ENST00000381980 SMARCA2P51531 1590 aa39.15■■■■□ 3.86
C4orf19-202ENST00000381980 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.13■■■■□ 3.85
C4orf19-202ENST00000381980 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.08■■■■□ 3.85
C4orf19-202ENST00000381980 TRIM41Q8WV44 630 aa39.06■■■■□ 3.84
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C4orf19-202ENST00000381980 HMGXB3Q12766 1538 aa38.61■■■■□ 3.77
C4orf19-202ENST00000381980 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.57■■■■□ 3.77
C4orf19-202ENST00000381980 ABCC8Q09428 1581 aa38.52■■■■□ 3.76
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C4orf19-202ENST00000381980 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.21■■■■□ 3.71
C4orf19-202ENST00000381980 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.19■■■■□ 3.7
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C4orf19-202ENST00000381980 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.93■■■■□ 3.66
C4orf19-202ENST00000381980 CFTRP13569 1480 aa37.93■■■■□ 3.66
C4orf19-202ENST00000381980 SOGA1O94964 1423 aa37.9■■■■□ 3.66
C4orf19-202ENST00000381980 EEA1Q15075 1411 aa37.89■■■■□ 3.66
C4orf19-202ENST00000381980 TOP2BQ02880 1626 aa37.78■■■■□ 3.64
C4orf19-202ENST00000381980 PRDM2Q13029 1718 aa37.76■■■■□ 3.64
C4orf19-202ENST00000381980 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.72■■■■□ 3.63
C4orf19-202ENST00000381980 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.72■■■■□ 3.63
C4orf19-202ENST00000381980 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.71■■■■□ 3.63
C4orf19-202ENST00000381980 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.69■■■■□ 3.62
C4orf19-202ENST00000381980 CUX1P39880 1505 aa37.56■■■■□ 3.6
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C4orf19-202ENST00000381980 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.1■■■■□ 3.53
C4orf19-202ENST00000381980 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.09■■■■□ 3.53
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