Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IKBKBO14920 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IKBKBO14920 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IKBKBO14920 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms